New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 624176 = | 75 (0.770) | 6 (0.060) | 6/554 | 11.1 | 7.8% | coding (335/957 nt) | fepB | ferrienterobactin ABC transporter periplasmic binding protein |
? | NC_000913 | 624218 = | 69 (0.730) | coding (293/957 nt) | fepB | ferrienterobactin ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTT‑CCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGTCAGTAATCTGACGCGGCCAGTCAGCGGCCTGAACTGCGGCTATTCCTGAAAGCAAAAGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACA > NC_000913/623922‑624511 | tGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGCTTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGtt < 2:351569/300‑1 (MQ=255) gTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGGCTGGCCACGGCTTCTGCGCTCGGTCCGC‑CGCTATAGAGCCTGTGGCGTTTGCGtt > 1:11744/1‑301 (MQ=255) aCCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGACCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTCCGC‑CGATATCGAGCCTGTGCatctgtcgttgtt > 1:411621/1‑289 (MQ=255) gtctgcgtggggagtttgttgtgCTCTTTCTCGGCCGCTGTTTGCTTATC‑CACTGACGCAATCCCCTCTGCGGCTTGTTTCTCAGCGCCGGTAATTTGGCAAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGAGTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCAGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCg < 1:684543/287‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCCGTAATTTGTATTGCTCTTCCCGCGCCGCCAGTTGCTTAGCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCg < 2:284380/301‑1 (MQ=255) tGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTTCAGTTTGCGTTTTTTCGccc > 2:724125/1‑300 (MQ=255) gcggcgGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGGGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGACGGTTGCGCTAATTAAAATCCAATCCGGCATTTCAGCGGCAACGGCTTCGTCGCTCGGTTCGCATCATA‑CGCGCCGTTGCAGGTTGCGTTGTTTcccctc > 1:727341/1‑299 (MQ=255) tAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCCTTGGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGGTAGAGAGCCGTTCCAGTTTGCGTTCTTTCGACTCCTTtctc > 1:184345/1‑301 (MQ=255) tttgatttgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCAGACAGTGCCATCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCTGCATTTGCTCTGCAACGGCTTTCGCCTTCCGTTCCG‑CGGTATAGAGCCTTTTGAGGTTGCGTTCTTTCCACACCCTgtctcac > 1:441382/1‑295 (MQ=255) ttgatttgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGAAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCGTACAGTGCCAGCGCCGAATCCCAGCCGGCTGCGCTAATTACAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCACAGGCTTCGTCGTTCGGTTCGC‑CGATATAGGGACACTGAAGGTTGGGGTCTTTCGCAACCTAGCTCCACt > 2:285198/1‑301 (MQ=255) atttgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTACCAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCTTACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCCACGGTCGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAGTTGCGCGGAACCGGCATCGGCGCTCGGGTCGG‑CGTTAGAGAGGCGTGGAGGTTTGCGGTTCTTAGGCACATGGCTCCGCTggg > 1:86520/1‑300 (MQ=255) atttgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCCCTGGc > 2:52815/1‑301 (MQ=255) ttgCACTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAGCGG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCAGGGCGAAGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCg < 2:441503/300‑1 (MQ=255) 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cgccgccAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTgg > 2:883030/1‑301 (MQ=255) acaaccgg‑cgcAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCTTGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGt < 2:184385/294‑1 (MQ=255) cAAACTG‑CGCAATCCGCTCTTCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGt < 2:722467/300‑1 (MQ=255) tccgtgctgccagccGTTCTGCTGTTTGGTTCTCAGGGCCGGTGATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGGGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGt < 1:12250/287‑1 (MQ=255) aaaCTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGCCGTAAAAAGCCCTGGTCCTCCGCCACGCGGtt > 2:654170/1‑300 (MQ=255) aaaCGG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAATTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTa < 2:890420/301‑1 (MQ=255) 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TGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTT‑CCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGTCAGTAATCTGACGCGGCCAGTCAGCGGCCTGAACTGCGGCTATTCCTGAAAGCAAAAGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACA > NC_000913/623922‑624511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |