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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
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gcggccTTTCTGTAAACAGAAGTAATTAGATTAAATAAGTTGGTTATCCTTTTGTCAGCATGATGTCTCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACCTACTAATGTTTTATGGTTTATTTAGCCGGATTTCATTAAGAGCCAGTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCGTAATACCCATCTGCATAAAACTCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTAtttt < 1:809855/298‑1 (MQ=255) ccgccTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCTGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTAtttt < 2:44952/300‑1 (MQ=255) gccTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTATTTATCCTAAAGGGGCATATTAGGAATTTACTTTATTTTTc > 1:286460/1‑300 (MQ=255) | AGCGGCAACCGACACGGCGGCGGCGCTGGGTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTC > NC_000913/1279150‑1279745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |