New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1096961 = | 106 (0.860) | 32 (0.360) | 8/416 | 10.5 | 29.4% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
? | NC_000913 | = 1097503 | 77 (0.870) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACG‑GTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCT‑TCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGC > NC_000913/1096670‑1097253 | tgCAACGCTTGTAGAATGGCTGATTTGGTTTGAAGCTGAGTTTTTACGCTGCTATGTACCGTGCTTAATTGACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGAGGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCAATTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtgtg < 2:393630/299‑1 (MQ=255) ggCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTCTGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTACGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGAAATTTGATGTT‑CACGATTTCCCCCCGCCCTACCCGAAGTGGGCGGGGGCACCCGgtgtgg > 1:635097/1‑300 (MQ=255) aGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGGGTGTGCAATATACG‑a > 2:610222/1‑300 (MQ=255) aTGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCGCGAACAGACGGGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATACATG‑aaaa > 1:526376/1‑300 (MQ=255) ggCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACACACGTGGGGGGGGGCACCCGGTGTGTGAACTATACG‑aaaaac > 1:150071/1‑299 (MQ=255) tttGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TTAGTAACCCGACAGTTGATGTG‑AACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGGGGGAGGGGGCACCCGGGTTGCGCAAAATACG‑AAAAAAAAcccatacat > 1:630145/1‑294 (MQ=255) tttGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTGAATAAGTGAGGAAGTGATGGGAAGTGACCAGATAATACATTTATGTTTTGTACTCTCTTGAGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGGG‑GCCGATTTCCGTTCGCCTTAATAGAATGGGGCGGGGGCACACGGTGAGGGCGATCACCG‑aaaaaaaaagacggg > 1:116520/1‑291 (MQ=255) tGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATAAATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGTTTGTTGAC‑TGAGTAACGAGACAGTTGTTGTG‑CACGATTTCCCCTCCCCCTAACAGACGAGGGCGGGGGCACCCGGTGTTGGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACttcc > 1:401101/1‑299 (MQ=255) gtcatcttgttctctttGCTCTTTACCTGGCTTAATTTACTTTTTTGTCTTTTGTCGAGTCCTCTGGCATGCCGATTTTATGATGGCATGTGACATGTACTTCCGTTGGGGGTATTTTAATAAGAGAGGAAGTGATAGTAACTGACCAGATAATACCTATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCAGTTTGAGTGTTGAC‑TGAGGAACCAGACAGTTGATTTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCCCCCGGGGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTa < 1:745211/285‑1 (MQ=255) gCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTACGTTTGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTTACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CCCGATTTCTCCTCTCCCTAACAGTCGTGGGTCGGGGCCACCTGTGTGTGAAATATCCG‑AAAAAAATATCCTTACTTGCGtcg > 2:344279/1‑299 (MQ=255) 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tcTATTTACCGTTCTTAATTTTCTTTTTTGTTTATTGTAGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTa < 1:1039489/297‑1 (MQ=255) gCTATTTACCGTGTTTAATTTACTATTTTTTCTATTTTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGGTAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTa < 1:97173/298‑1 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGGTAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAACAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTa > 2:97194/1‑298 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat < 2:454637/301‑1 (MQ=255) gCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAGGCCCGTACTTTCGTACGCGCTCTTCTTTATATATGGCgggcagg > 2:115367/1‑296 (MQ=255) tttACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTTATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AACAAAACGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTCAATATGGCGGGTC‑gggggggg > 2:579556/1‑300 (MQ=255) cTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTg > 2:1093081/1‑300 (MQ=255) tttttttCGTTTGTCAAGTCATCAGGCATAACGATTTTATGGTGGCATGTGACAGTGATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTATTTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTGAc < 2:526520/299‑1 (MQ=38) gttttttttATTTTTGGTTTCCCTGTCGTAACGATTTTATGATGGGAGTTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTTATAAGTGAGGAAGGGATAGGAAGTGACCAGATAATTCATGTATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTGGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTGAc < 1:610049/299‑1 (MQ=38) 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ggCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACG‑GTCTGTCCAACTGGCTGTCGCAAGTTGTCGACCCCCGGGCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAACATCCGAAACAATAACCCGACATTTCGTAAG‑GGTCTCTCTTTAAATTGGGAGGTGGGGGGGGGTTTGACTTGCTTCGCTCGCCCTGCggggtaccc > 1:1080393/1‑295 (MQ=11) ggggggCACCCGGTGTTTGCAAGATACG‑AACAAAAATCCCGTACTTTCGTACGTGCTCTTCTGTAAATATGGCGGGGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACG‑GTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCT‑TCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGc < 2:401214/300‑1 (MQ=255) | GGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGAC‑TGAGTAACCAGACAGTTGATGTG‑CACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACG‑GTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCT‑TCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGC > NC_000913/1096670‑1097253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |