| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3103426 | 114 (0.870) | 4 (0.030) | 4/556 | 17.8 | 3.5% | coding (414/1053 nt) | mutY | adenine DNA glycosylase |
| ? | NC_000913 | = 3103489 | 107 (0.840) | coding (477/1053 nt) | mutY | adenine DNA glycosylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GATGTTGCAACAAACTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATGCTGTAAGCGGCTGGCCTGGGAAAAAAGAGGTCGA‑GAATAAATTATGGAGTTTGAGCGAGCAGGTGACGCCCGCGGTTGGCGTGGAACGGTTTAATCAGGCGATGATGGATTTGGGTGCGATGATTTGTACGCGCTCGAAACCGAAATGTTCGCTCTGTCCGCTACAAAACGGATGTATTGCCGCCGCCAACAATAGCTGGGCGCTTTATCCGGGCAAAAAACCGAAACAGACGCTGCCGGAGCGCACCGGCTACTTTTTG > NC_000913/3103126‑3103720 | gATGTTGCAACAAACTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGAc < 2:463662/301‑1 (MQ=255)gATGTTGAAACAAACTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGAc < 2:863539/301‑1 (MQ=255) tctaaCCCAGGTTGCGACCGTTTCCCCCTATTTTGACCGCTCTATGGC‑CCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGt < 1:526447/297‑1 (MQ=255) acaaACTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGGCCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCCGCGGTAACGTc > 2:1150427/1‑301 (MQ=255) aaCTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCCCTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGCTTCTCTCGCTTTCTCTGGGTACGCACTTTCCGCTTCTCGACGGTAACGTcgct > 2:526584/1‑298 (MQ=255) cAGGTTGCGACCTTTATCGCCTCTTAGGCACGCGTGATGGC‑GCCCTTCCCGACGGTGACCGAGCTCGACAATGCGCCGCTCGACGAAGTGCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTCCGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACTCGGCGGTAAATTCCCGGAAACCGTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAAcgcg < 2:484394/301‑1 (MQ=255) tGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCGGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTCACGTCCAACGCGTGCTg > 2:689354/1‑301 (MQ=255) tGCCACCGTTCTCCCTCGTTTTGATCGC‑TTGTGGCAGCCCTTCCCTACGGTGACCTATCCGCCCAATGGTCCGCTCGACGGAGTTCATCACTGGTGGACCGGGCTTGCCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATACAGCGGCACAACAAGGGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGCGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCt < 1:787738/300‑1 (MQ=255) aCCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAACTTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCCGGCGCGATTCCCTCGCTTTCTCTTGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGCCGGTAACGTCCAACACGtcccggggg > 1:1112985/1‑293 (MQ=255) aCCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGGGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGGCCAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATCCACGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGTGCGCGGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCCCGCTTTCTCTCGCTAAGCCCTTTCCGGTTCCCGGCGGGAACGTCAGACGTGTTCTGgcgg > 2:812845/1‑300 (MQ=255) ccGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGGTTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGATGgcgcg > 2:534370/1‑301 (MQ=255) gTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCATCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGgcgcccc > 2:1045088/1‑298 (MQ=255) cgccccTATTTTGACCCCTTTGAGGC‑CCGCTTCCCGCCGGTGCCCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCgctgct < 1:534233/299‑1 (MQ=255) aTCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTCTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTTGGTAAGCCCTTTCGGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTTCTGCCGCgttgct > 1:945417/1‑301 (MQ=255) aTCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCCATCTCGCCAATACGACTCTCTACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGTCTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAAGCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCgctgc < 2:264508/300‑1 (MQ=255) aTCCCCTAGTTTGAACGCCTTGTGGC‑CCTCTTCCCGACGGTGACCCGTCTCGCCAATGCGCCGCTCAACGAATCTCTCCACTGGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCgctgc < 1:864592/300‑1 (MQ=255) ccccTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCCTAAATCGGCACCACAAGGAGCGACCTTACACCGCGGTACATTCCCGGCAACCTATAAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGACGGGCGTTCCACCGCGGCCGCGATCCTCTCGCTTTGCCTGGGAAAGAACGTACCGATCCGAGACGGTAACGGCaaaagaagcggaacagagtcgg > 1:204388/1‑280 (MQ=255) ccccTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGGGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAAc < 2:204438/281‑1 (MQ=255) cccTATTTGGACCGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGAGCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATg < 2:194028/301‑1 (MQ=255) ccGCTTTATGGC‑GCGCTCCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACACCAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATGCTGTAAGCGGc < 2:77923/300‑1 (MQ=255) cTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGGAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTGTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTGGACGGTAACTTCAAACGCGTGCTGTGGCGCTGCTCTGCGGTATGCGGCTgg > 2:1147767/1‑301 (MQ=255) tcaggC‑GGGCTCCCCGACGGGGACCGTGCTGGCCACTGCGCCCCCCGACGAAGTTCTCCCCTTGTGGGCCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGGGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCATCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATGCTGTAAGCGGCTGGcc < 1:1044827/297‑1 (MQ=255) 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gc‑gcgcTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAATCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACAGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGGCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGGAAGCACTTTCCGACTCTCGCCGGTAACGTCAAACGCGGGCTGGCGCGCTGCTCTGGTGTAAGCGGCCGGCCTgggg > 1:986859/1‑300 (MQ=255) gTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGTGCTTCTCTCGCTTACTCTGGGTAAGCACTTTCAGATTCTCGCTGGTAACGTCAAACGCGCGCTGGCGCGCTGCTATGCCGTAAGCGCCTGGCCTGGGTAAAAAGAgggagagg > 2:283753/1‑295 (MQ=255) aCCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTCTGCTGTAAGCGGCTGGCCTGGGAAAAAAGGGGTCgg‑ga > 1:741223/1‑298 (MQ=255) 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cTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATGCTGTAAGCGGCTGGCCTGGGAAAAAAGAGGTCGA‑GAATAAATTATGGAGTTTTAGCGAGCAGGTGACGCCCGCGGTTGGCGTGGCACGGTTGTATCCGGCGATGATGGAGTTGTGTGCGAGGATTGGTACGCGCTCGAAACCGAAATGTTCGCGCTGTACGCTAAAAAACGGACGTTATGCCCCCGCTACCAATCGCAGCGCGCTTTCTGCGCGCAGAAAACC‑AAACacgccgtgcagcgtgctgactggg > 1:475695/1‑278 (MQ=255) ttCCGATGCTCGGCGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTAGGCTGTAAGCAGGTGGCCTGGGAAAAAAGAGGTCGA‑GAATAAAGTATGGAGTTTGAGCGAGCAGGTGACGCCCGCGGTTGGCGTGGAACGGTTTAATCAGGCGATGATGGATTTGGGTGCGATGATTTGTACGCGCTCGAAACCGAAATGTTCGCTCTGTCCGCTACAAAACGGATGTATTGCCGCCGCCAACAATAGCTGGGCGCTTTATCCGGGCAAAAAACCGAAACAGACGCTGCCGGAGCGCACCGGCt < 1:349365/300‑1 (MQ=255) gctcGACGGTACCGGGAAACGCGTGCTGGCGCGCGGCTAGGCGTTAAGCGGCTGGCCTGGGAAAAAAGAGGTAGA‑GAATAAATTATGGAGTTTGAGCGAGCAGGTGACGCCCGCTGTTGGCGTGGAACGGTTTAATCAGGCGATGATGGATTTGGGTGCGATGATTTGTACGCGCTCGAAACCGAAATGTTCGCTCTGTCCGCTACAAAACGGATGTATTGCCGCCGCCAACAATAGCTGGGCGCTTTATCCGGGCAAAAAACCGAAACAGACGCTGCCGGAGCGCACCGGCTACTTTTTg < 2:635739/300‑1 (MQ=255) | GATGTTGCAACAAACTCAGGTTGCGACCGTTATCCCCTATTTTGAACGCTTTATGGC‑GCGCTTCCCGACGGTGACCGATCTCGCCAATGCGCCGCTCGACGAAGTTCTCCACTTGTGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAGTGGCGACCTTACACGGCGGTAAATTCCCGGAAACCTTTGAGGAAGTTGCAGCACTGCCGGGCGTCGGGCGTTCCACCGCAGGCGCGATTCTCTCGCTTTCTCTGGGTAAGCACTTTCCGATTCTCGACGGTAACGTCAAACGCGTGCTGGCGCGCTGCTATGCTGTAAGCGGCTGGCCTGGGAAAAAAGAGGTCGA‑GAATAAATTATGGAGTTTGAGCGAGCAGGTGACGCCCGCGGTTGGCGTGGAACGGTTTAATCAGGCGATGATGGATTTGGGTGCGATGATTTGTACGCGCTCGAAACCGAAATGTTCGCTCTGTCCGCTACAAAACGGATGTATTGCCGCCGCCAACAATAGCTGGGCGCTTTATCCGGGCAAAAAACCGAAACAGACGCTGCCGGAGCGCACCGGCTACTTTTTG > NC_000913/3103126‑3103720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |