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aCCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAACCTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATTTTTTCAGTTTTCATGTTTTCGTGTCGGCAGTCAGGTTCCCTGCAATTGTTGTAAATGATGCTGTGTTGGCGGGGTCCGTTTTGTTCCTTCAGCTTTAAATaat > 1:1101458/1‑300 (MQ=255) aCCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGGTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACa > 2:916598/1‑299 (MQ=255) ccTGACTGTCGTCGTTAATGCCACCTTCCTATCCGCTGCCTTCAGTTGCATGGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATAGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGTTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACAAGTg < 1:1207699/301‑1 (MQ=255) ccTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGTTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACACGTg > 2:1072425/1‑301 (MQ=255) cGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGTTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACAAGTGATGcc > 2:222092/1‑301 (MQ=255) cGGTCGCCCTTAGTGCTCCCATCATACCCGCTGCCTCCAGTTGCATCGCTCCGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGCCAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGTGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGTTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACAAGTGATGcc < 1:639487/301‑1 (MQ=255) | GGCATTCGCTGCGACGTTGATAGTGAACCGTGCCCCGGTAAAATGACGAGCATCATTCAGGCTGACAAAATGTTCGATCACCGTTGCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGT‑CGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGCCCTGGGTGATATGCATTAACAGCAATGGCTTTGCCGGCCGTTGACCGC‑GCTTCACGGCGATATGCGTCACGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACC‑AGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTGTCGGCAGTCCGGTACGCAGCAATTGTTGTAAATGCTGCTGTGCTTGCGGGGAGCGTTTTGTCCCTTCAGCTTCAAACAAGTGATGCC > NC_000913/1761159‑1761751 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |