| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,073,641 | C→A | intergenic (‑70/‑98) | yihU ← / → yihV | 3‑sulpholactaldehyde (SLA) reductase, NADH‑dependent; gamma‑hydroxybutyrate dehydrogenase, NADH‑dependent/6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,073,641 | 0 | C | A | 97.5% | 507.0 / NA | 157 | intergenic (‑70/‑98) | yihU/yihV | 3‑sulpholactaldehyde (SLA) reductase, NADH‑dependent; gamma‑hydroxybutyrate dehydrogenase, NADH‑dependent/6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (81/72); minor base T (2/2); total (83/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GAACAACACGTTGCGCACCAGATCGCCATTCGGCAACATGGTAATGATAAATTCGGCATCTTTAGCGGCCTGCGCCGGGTTGGCGGCGGGAGTCGCACCTTTGTCTACCAGATGCCGCACAGCTTCGGCGTTCACATCAAAGACGCGAAGTTGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTGCGGCGGCAAGGCTGGGGGCGCAGGTCGATTTTATTGGTCGCGTAGGTGATGACGACACG > NC_000913/4073344‑4073936 | gaccaacaCGGAGCGCACCAGGTGTCCATGCGGCAACCAGGTAATGTTAATTTCGGATTCTTGAGGCTCCGGCGCCGGGTTTGCGGAGGGAGTCGAACCGTTGTCTACCAGAGGCCGCACAGCTTCGGCGGTCACGTCAAAGGCGCGAAGTGGATGCCCTTGCTGCAATAAATTCCTCGCCATTGGCGAACACATGTGTCCTAAACCGATAAACGTGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATAGTa < 1:1261969/298‑1 (MQ=255) 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GAACAACACGTTGCGCACCAGATCGCCATTCGGCAACATGGTAATGATAAATTCGGCATCTTTAGCGGCCTGCGCCGGGTTGGCGGCGGGAGTCGCACCTTTGTCTACCAGATGCCGCACAGCTTCGGCGTTCACATCAAAGACGCGAAGTTGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTGCGGCGGCAAGGCTGGGGGCGCAGGTCGATTTTATTGGTCGCGTAGGTGATGACGACACG > NC_000913/4073344‑4073936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |