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aGCCAATATCTAATAGTGGACGATCAACCGGGTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGcc > 2:307497/1‑230 (MQ=255) aGCCAATATCTAATAGTGGACGATCAACCGGGTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGcc < 1:307504/230‑1 (MQ=255) atCTCATAGTGGACGATCAACCGGGTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAg > 1:1027014/1‑148 (MQ=255) atCTAATAGTGGACGATCAACCGGGTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAg < 2:1026966/148‑1 (MQ=255) ggTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGCCCTTAACATTGATCGTTAt < 2:547242/218‑1 (MQ=255) ggTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGCCCTTAACATTGATCGTTAt > 1:547253/1‑218 (MQ=255) cATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGAtt < 1:168770/137‑1 (MQ=255) cATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGAtt > 2:168766/1‑137 (MQ=255) cGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGCCCTTAACAt < 2:73400/184‑1 (MQ=255) cGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGCCCTTAACAt > 1:73403/1‑184 (MQ=255) | AGAGATTTCACAGCGGTGGCAACCCGTGCATCGCGCTCGCTGGGTCACCAGCACCCCTTTGGGGGTATTTATCAACCCTACTGTGCCGCTATCAATATCTTCCTGTTTGCAACCCAAAAGTGACAGTAACGCAGGGGCAATTGTTAGACCAGCAAGGCCTTTTCCTGATATACGCAAGAATTCTAATCGCGTTAAGCCAATATCTAATAGTGGACGATCAACCGGGTTCATTTATTTCGCATCCTCTTCGCAAACACAGTGCTGACAATTCAGCAGCCTGATATTAAGCATTCAACTAATACGCTGCTGACTCTGTCCCCAACACCAGATATTTTCCCTAACCCGATAGTGTATGAGAAAAGATTAACGCCGATAAACTAATCCTTTATGGTTAGGAGAAAAAATAATGTGATTATTCTGAGCCCTTAACATTGATCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAG > NC_000913/1754247‑1754719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |