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tCGCCAGCGCCCTGATGCGAGAGATGATTGAAATGTGCGACAACTGGTTGCGGGTAGATCGCATTGAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTgaga < 1:526996/300‑1 (MQ=255) gCATTGAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGAt < 2:447202/149‑1 (MQ=255) gCATTGAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGAt > 1:447212/1‑149 (MQ=255) gAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTg < 2:391802/232‑1 (MQ=255) gAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTg > 1:391812/1‑232 (MQ=255) aaCTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCTCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGAt > 2:185997/1‑235 (MQ=255) aaCTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGAt < 1:186001/235‑1 (MQ=255) gTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatata > 2:953801/1‑190 (MQ=255) gTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatata < 1:953835/190‑1 (MQ=255) tGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTc < 2:332806/178‑1 (MQ=255) tGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTc > 1:332815/1‑178 (MQ=255) gCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGtatttatt < 1:842280/122‑1 (MQ=255) gCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGtatttatt > 2:842252/1‑122 (MQ=255) tAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACa > 1:674501/1‑130 (MQ=255) tAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACa < 2:674485/130‑1 (MQ=255) atatTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTc < 1:995805/41‑1 (MQ=255) atatTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTc > 2:995766/1‑41 (MQ=255) | TTGATGGAGACGTCGTGGGCCATCTCACCATTGACGTGCAACAGCGCCCACGCCGCAGTCATGTTGCCGATTTTGGTATCTGTGTCGACTCTCGTTGGAAGAACCGCGGCGTCGCCAGCGCCCTGATGCGAGAGATGATTGAAATGTGCGACAACTGGTTGCGGGTAGATCGCATTGAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTC > NC_000913/3581310‑3581728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |