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cACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCaaa > 2:654969/1‑300 (MQ=255) ccAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaataa > 1:453417/1‑110 (MQ=255) ccAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaataa < 2:453407/110‑1 (MQ=255) gAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAGGTTGCg > 1:591944/1‑301 (MQ=255) aTCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAGGTTGCGAATCa < 2:857458/299‑1 (MQ=255) aTCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAGGTTGCGAATCAtt > 1:803144/1‑300 (MQ=255) aTCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAGGTTGCGAATCATg > 2:342488/1‑301 (MQ=255) | GATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAATTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACAGGTTGCGAATCATG > NC_000913/1198477‑1199071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |