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aGCCTGTGCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGAAGGCTTACTGGt > 1:454203/1‑301 (MQ=255) ccTGTGCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGAAGGCTTACTGGTc < 1:1093355/300‑1 (MQ=255) gtgCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGCGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTGTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGAAGGCTTACTGGTCAGCg > 1:743639/1‑301 (MQ=255) gtgCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAg > 2:659426/1‑258 (MQ=255) gtgCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAg < 1:659441/258‑1 (MQ=255) gCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCAAATCTCAGCCGCAGCCGGTTTGAAGGGTAACTgctaaggtgt > 2:320850/1‑292 (MQ=255) ttCCAAATCAGGGATTTCACCTGCTGGTTAAAACCAGTAATTATAATGAGTGATTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCGGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGGCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGAAGGCTTACTGGTCAGCGATCTTg < 2:577943/299‑1 (MQ=255) gTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAACCACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATACGCCCAAAATTGACGGTTTTCCGGAGTCTAATATCGGCCGAGACCTTTTTGAAGGCTTAATGGTCAGCGATCGTgg > 2:679693/1‑300 (MQ=255) gTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGCAGGCTTACTGGTAAGCGATCTTGa > 2:929953/1‑301 (MQ=255) | TAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAGGGGAGACACAGTACGAATCGACATAAGGTGATCGTCTGAATCACCAGAATAAATAAAGTCGGTGATAGTAATACGTAACGATAAAGTAACCTGACAGCAGAAAGTCTCCGAGCCTGTGCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACATCACCAAGAGAAGTTTAGTAGCAGCTGGCGTTCTGGCTGCGCTAATGGCAGGGAATGTCGCGCTGGCAGCTGATGTACCCGCAGGCGTCACACTGGCGGAAAAACAAACACTGGTACGTAACAATGGTTCAGAAGTTCAGTCATTAGATCCGCACAAAATTGAAGGTGTTCCGGAGTCTAATATCAGCCGAGACCTGTTTGAAGGCTTACTGGTCAGCGATCTTGA > NC_000913/1300825‑1301417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |