| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,183,621 | 0 | G→C | 8.5% | 37.0 ‑0.5 ‑0.0 | 182 | E793Q (GAA→CAA) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/6): ref base (88/78): total (98/84) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.02e-01 | ||||||||||
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Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
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aCGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGAcc < 2:688504/301‑1 (MQ=255) cGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTgg < 1:288655/300‑1 (MQ=255) cGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGAc < 1:440592/301‑1 (MQ=255) cTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATTCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGCAGACCGTTTCACCACCATCCACATCCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGCCACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGAAATCCCGAACGTTGGTGAAGCAGCGCGCTCCAACCCGCATGAATCCGGTATCGGGTCCATTGGTGCGGAAGGGAACGGTGGGGaactt > 2:1058005/1‑296 (MQ=255) ggCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTCGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGCACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATACCGAACGTGGGAGAAGCTGCGCCATCCAAAATGGATGAATCCGGTATCGTTTACCTTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGAGAACTTCtt > 2:17962/1‑300 (MQ=255) ccACCGACCTCGGGGAAAAGGCGCGTGGTCAGAAAATGCGCGTAGCGTGCATGGCGTGGACTGGTTACAAAGTCGAAGCCGCCATCACCTGATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAGGACCGTTTCACCACCATCCACAGTCAGGAACTGTCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGGTGGGTCCGGAAGAGATGACCGCAGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCGGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGGATCGATTACGTTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGACATTCTGGTTggtaaggtaa < 2:100888/300‑1 (MQ=255) | CGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGACATTCTGGTTGGTAAGGTAACGCCGAAAGG > NC_000913/4183326‑4183916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |