| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,383,196 | Δ3 bp | 2.6% | coding (997‑999/1068 nt) | degS → | serine endoprotease, periplasmic |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3383199 = | 118 (1.020) | 3 (0.030) | 3/536 | NT | 2.6% | coding (1000/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | NC_000913 | = 3383195 | 112 (0.980) | coding (996/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CGGCTTTGCGATTCCTTTCCAGTTAGCAACCAAAATTATGGATAAGCTGATCCGCGATGGTCGCGTGATCCGCGGCTACATTGGTATCGGCGGACGTGAGATCGCACCACTGCACGCGCAGGGCGGTGGTATAGATCAACTGCAAGGGATCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGGGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCGGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGAGAGAAGAAACGGGCGTACT > NC_000913/3382895‑3383493 | tttGCGAGTCCGTTCCAGGTAGCAACCAAAATTATGGATAAGCTGAGCCGGGATGGGCGCGTGATCCGCGGCTACATTGGGATCGGCGGACGGGAGATCGCACCACTGCACGCGAAGGGCGGTGGGATAGATCAACTGCAAGGGATCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGGGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCGGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTgtag > 2:742781‑M2/1‑297 (MQ=255) tcgcttCCTTTCCACGTCTCAACCAAAATTAGGGATAAGCTGATCCTCGTTGTGCGCGTGATCCGCGGCTACATGGGTATCGGCGTACGTGAGATCGCATCACTGCACGCGCAGGGCGGTGGTATAGATCAACTGCAAGGGACCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGTGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCTGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGtagtag < 1:840965/297‑1 (MQ=255) ggATTCCCTTCCAGTGAGCAACCAAAAGTAGGGATAAGCTGGTCCGCGAGGGTGGCGTGATCCGCGGCGACATTGGGATCGGCGGACGTGAGAGCGGACCACTGCACGCGCAGGGCGGTGGGATAGATCAACTGCAAGGGATCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGGGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCGGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGtagtag < 2:866053/299‑1 (MQ=255) cGATTCCTTTCCATTTAGCAACCAAAATTAGGGGTAAGCTGATCCGCGAGGGTCGGTTGATCCGGGGCTACATTGGTATCGGCGGAAGTGAGATCGCACCACTGCACGGGCAGGGCGGTGGTATAGATCAACGGCAAGGGATCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGGGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCGGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGtagtag < 2:597651/300‑1 (MQ=255) 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ttCGGGGATCCCTGTAGTAGGGATGCGTGATTATAAGCAGGTACAGCTTCCGGTCACCATTCAGTAATATCCTGCAACCAAGTAAGTAGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTACGGTGTTTTATTAGCCGCGAATCAAGTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGTTGATATCTTTCCTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCTATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGAGAGAAGaaa < 2:382680/301‑1 (MQ=255) gATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGAGAGAAGGAACGGGCg > 2:243348/1‑301 (MQ=255) tCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCCGCGGTTGAGAGAAGAAACGGGCGTa > 2:333317/1‑301 (MQ=255) tCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTAGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCATATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTATGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGCTTTCAGCTATTCCACGCCGTTTTTCCACAGCAGCCGCGGTTGACAGAAGAAACGGGCGTa > 1:766359/1‑301 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGAGAGAAGAAACGGGCGtc > 1:800450/1‑297 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACAGGAGTCTGTGCTCCGGTTTGTTATTATACGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGCTAGATTTACGCTCTTACACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGTGAGAAGAAACGGGCGTa > 1:776620/1‑298 (MQ=255) | CGGCTTTGCGATTCCTTTCCAGTTAGCAACCAAAATTATGGATAAGCTGATCCGCGATGGTCGCGTGATCCGCGGCTACATTGGTATCGGCGGACGTGAGATCGCACCACTGCACGCGCAGGGCGGTGGTATAGATCAACTGCAAGGGATCGTGGTTAATGAAGTGTCACCTGACGGCCCGGCGGCGAATGCGGGTATTCAGGTCAACGATCTGATTATTTCGGTGGATAACAAACCGGCCATCTCTGCTCTGGAGACGATGGATCAGGTGGCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGTTGAGAGAAGAAACGGGCGTACT > NC_000913/3382895‑3383493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |