New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGCCTATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAAC‑GTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAGCCAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCAT > NC_000913/803041‑803637 | tctcattGCTATGTTATCGGTGTTTGCCATGCTGGCGACA‑CTCTCCGGCACACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCCCTGTTGTTCTCCAACTCGTAGGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGAGCGGCGGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAGTCCTGGTGGTTGGTCTGTGCGGTACTGACTATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCa < 1:212959/295‑1 (MQ=255) gtATGTTAACGGTATTTGCCATGCTGTCGACC‑GTCTCCGGCGCACCGTTGATGTGAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTAGGGCGGCATCGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTTCGGTCAGCTTTGGCGTGGGTTATAACGTTATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcg < 2:93444/300‑1 (MQ=255) cTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAAC‑GTCTCCGCCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGCTATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGGGGAATATGTTGATCCGCTGGAACATGC‑GTAAGATATTCACTTCTCACTTCAAGTTGCAttgtctgcg > 1:204621/1‑293 (MQ=255) atatttttggggTATTTGCCAGGCTGGCGAACTGTC‑CCTGCGCAGCGTTAGTGTTAACCGCGGTGGGACTGTTGTTCTTCACATCCTATGGCGGGATGGGTACTCACTATGGCGGCGCGGTAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGTTAGTAAATCCTGGTGGTGGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcg < 1:1089054/291‑1 (MQ=255) ggggaTTTGCCGTGCTCGCGAAC‑GGCTCCGGCGCACCGTGACGGTTAACCGGGCTGGAACTGTTGTTCGCCAACTCCTAGGGCGGCTTGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGTTTATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTc < 1:633583/297‑1 (MQ=255) cccctggtGGCGACC‑TTCTCCGTCGACCCTTTAATGTTAACCGCTCTGGCACTTGTGTTCTCCAAGTCCTATGGCGGCATGTTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGGGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAccc < 1:458149/294‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAAC‑GTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTACCCTGTCTGGTGCATACCACCCTCGGCGGGCG‑GGGGTGGAATATGCTGATTGGCTGGTACATGATGTAT‑ATATTCTCGTCCTAATTCATGTTGCATGTGCTTCGTCTGCGTTCGCTcccccc > 1:536770/1‑299 (MQ=255) aTGCTGGCGAAC‑GTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTTCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcccc > 2:243436/1‑299 (MQ=255) ggCGCAC‑TTCTCCGACGCACCGTTAAGTTTAACCGTGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTTCTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATGAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCact < 1:530862/301‑1 (MQ=255) ggCGAAC‑GTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATCTTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCTTATCACCCTCGGCGTGTG‑GGGGTGGAATATGCTGAGCGGTTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcccctgacagt > 1:162201/1‑294 (MQ=255) 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cGTCATACTTAAATTTGCATTTGTTGCTTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCATGGTGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAAAGAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAGCCAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATtctc < 2:115947/301‑1 (MQ=255) tACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAACAAAAAAAGGCAATAATGCATGGTTGATtcaccattt > 1:333546/1‑294 (MQ=255) aCTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGCGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAATAAGCCAAAAAAGGCACGATTTCCTGGTCTATTCTCTCTTCg > 2:199713/1‑301 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAACTAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAGCCAAAAAAGGCACTAATGCCTGGTCTATTCTCCCTTAGc > 1:261624/1‑301 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGAAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAGCCAAAAAAGGCACTAATGCCTGGCTTATTCTCTCTTCGc > 2:1035879/1‑301 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCAAGTAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTGAAATGGAGAAATTAAAAAAGAAGCAGCCAAAAAAGACAAAATTGCTTGGTTTATACTCACTTCGc > 1:104219/1‑301 (MQ=37) | TGCCTATATCGTTGCTATGTTACCGGTATTTGCCATGCTGGCGAAC‑GTCTCCGGCGCACCGTTAATGTTAACCGCGCTGGCACTGTTGTTCTCCAACTCCTATGGCGGCATGGTTACTCACTATGGCGGCGCGGCAGGTCCGGTCATCTTTGGCGTGGGTTATAACGATATTAAATCCTGGTGGTTGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTG‑GTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAA‑ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACGGTGCGCAGATATCTGGAGCATTTGATGATCAAGTTATCTGAAAAAGGCGTGTTTCTCGCCAGTAATAACGAAATAATTGCCGAAGAACATTTCACCGGCGAAATTAAAAAAGAAGAAGCCAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCAT > NC_000913/803041‑803637 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |