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ctcCGCTGAGATGATGCTGCGCC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACATATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTACCGTTGTTTTTTGTTAGGACGCTAACGGTTATCAATATTTTATCAAAACAAGTTATAAAAACCCTTCGGTAGTTTTGGGGt > 1:822101/1‑300 (MQ=255) agatgcaagtgtgctggGCA‑GCATGGGTTGGACTG‑AAGCAGCTGTCTTAATTGTTAAAGGCAG‑TGAAGACGCAATCAACGAGAAATCCATAACATATGACTACGAGCGTATGATGGATGGGGCTAAACGGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAAGTGATTAAC‑GGGAACGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGc < 2:400984/290‑1 (MQ=255) tGAGATGATGCTGCGCC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTgg > 1:546664/1‑301 (MQ=255) tgatgCTGCGCC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGttt > 2:336052/1‑283 (MQ=255) gctgcGCC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAATACCCCTCTGTAGTTTTGGGGTAGGCAGGCCGGTCAgg > 1:334713/1‑301 (MQ=255) gcgcC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGAAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggt < 1:545433/299‑1 (MQ=255) gtgccgaaTGGGTTGAACCC‑AGGCGGCTGACATAATTGTTAAAGTGAT‑GGACGTAGCAATCAACGAGAAAACCGTAACCTATGACTTGGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggtgg < 1:42287/294‑1 (MQ=255) ggACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCGGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATAAAAATTTTATCAAAAAAATTTATCAAAACCCACCGGTAGTTTTGGTGTAGGATGGTCGGTCCGGTGGTAGTTttaatactt > 1:245850/1‑300 (MQ=255) gCTGACTTCATTTTTAAAGGAAG‑GGAAGGAGAAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt < 1:201432/301‑1 (MQ=255) | GTCATTAAAGACGTGATTGCTGATGCATTCCTGCAACAGATCCTGCTGCGTCCGGCTGAATATGATGTTATCGCCTGTATGAACCTGAACGGTGACTACATTTCTGACGCCCTGGCAGCGCAGGTTGGCGGTATCGGTATCGCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTC‑TATTAT‑TCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCC‑ACATGGGTTGGACCG‑AAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAT‑GGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAC‑GGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAT > NC_000913/1195948‑1196539 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |