Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
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cGACCCAACACC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTCGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTTTCACAGTGCAACGTAACGTACTGAAAACGGCTGAACAATATTTATTGCAATTTTGAGCAAAGCCCGT‑TATGTTAACGGACAAGTAGTGAAAAGCAAGAC‑ATGTAATGGAAAATAAATATTACAGGTTACAACTCAGAATCCACTGTGATGTCTTTTTatgg > 1:727256/1‑298 (MQ=255) aCCCAACACC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTTTTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCCAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTTACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAATGGGGGAATAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGT‑TATGTTACAGGAAAATTATGTTAAAGTAGGAA‑ATGTTCAGGAAAATAAATATAAAAGGTTACAAATCAGCATTTAATGGCTGTAATTTTTAATGGt > 2:597753/1‑301 (MQ=255) cAACACC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGT‑TATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAA‑ATGTTATGGACAATAAATATTAAAGGTTACAAATAAACATTCAATGGCTGGTCTTATTACTGGTTAt > 2:659272/1‑301 (MQ=255) cAACACC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGG‑TATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCATGAA‑ATGTTATGGAAAATAAATATTTCATGTTACATATACTCATTCACTGGCGTGTTTTTTATCTGGtttt > 2:776720/1‑299 (MQ=255) acacC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACGTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGT‑TATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAA‑ATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCtttt < 2:392721/289‑1 (MQ=255) cc‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAACGAAATTTTGAGAAAAGACCGT‑TATGTTAATGGAAAATTATGATAAAGCAGGAA‑ATGTTATGAAAAATAAATATTCAAGGTTAGAAATCAGCATTCACTGGACGCTCTTTATTCTTGTTATCGccg > 2:286912/1‑299 (MQ=255) | TTCGCACCAGCATCAAGATGCGCCTGCGATTTCTCGGCGGAGGTATAAAAGCCAGTACATTCGACAATGATTTCTGCACCTTTCGCTTTCCACGGAATATTTTTAGCCTCTTTTTCGGCGTAAACCGCGATACTTTTCCCATCAACGATAAGTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAAT‑CATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTATGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACC‑AGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGT‑TATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAA‑ATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAG > NC_000913/1490370‑1490968 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |