| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3798233 | 198 (1.160) | 10 (0.060) | 9/546 | 18.6 | 5.0% | intergenic (+26/+6) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis |
| ? | NC_000913 | = 3798235 | 188 (1.150) | intergenic (+28/+4) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
GGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3797921‑3798233‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taagaagtgagttTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACGTTAGAAAACTC < NC_000913/3798235‑3797938 GGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTACCAATACAATTAATTAAGAATAAACAATTTT > 1:1335014/1‑301 TAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAAATATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAA > 1:199440/1‑300 TAAAAGGGGAATTTAATTTTTCTAACGTACATCGACATAATGAGTTAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGAGTTGATTGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTTACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGTTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAA < 1:1229578/300‑1 aatagggggattttgattaTCTAACTCAAATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGAGCACTGAAAGGTCTGATGTGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTGTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 2:1496854/282‑1 AAGAGTGGCATTGGAGTTTTCTAACTTACATCTACATAATGAGATAATTTAAGCAGGGTTACTGTAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 1:339239/301‑1 AAGAGGTGCAATTGAGTTTTCTAACGAACATCTACATAAGGAGATAATTGAAGCATGGTCACTGAAAGGTCTTATTGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 2:1053502/301‑1 AAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAGGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 2:673582/301‑1 GAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA > 1:1234167/1‑300 GAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGATTTGGGTTTGTTGATATTAAAGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCTTATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTCACAATACAATTAATTATGAATAAACACGTTTAAGAA > 1:1452967/1‑300 gtgaagtgaAGTTTTCTAACATACATCTACAAAATAAAGAAATTGAAGCAGGTTAACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCAATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGTGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGTGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGA < 1:407460/292‑1 ATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCATTTATCATTATATCCGCTATAGTCTTCTTACTCGTCCTTCATAATTGTTAAAATACAATTAATTTAAAATAAAAAAGTTTAAAAAGTtatat > 2:605308/1‑295 aaATCTTCATAATGAGATAATTGAAGTAGGGTCACTGAAATGTCTGATGGTAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACT < 1:1096741/299‑1 ACATAGTGGAATAATTGGAGCAGGGTTAATGAAAGGTTTTATGTAAATTTTTTCCACACTTTTCCTTTATTTTTCACTATGTTAGATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTAGGGATTGGACTCAGTGATGTAATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAGACTTGTTTA < 2:1001569/301‑1 ATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTACCATTATATTCGCTATAGTCCTCTTACTCGTTATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACCAGTTTAAAAAGTAAGTTTTAACTTACTTCTTAAAATTTTTTATT > 2:982676/1‑301 attttataacaaataaaaaaaattaagTTTGGGTTTGTTAATATTAAGGCGTAGCATTGTGGGGATTTGACTCAGTAATGTATTCATATGGGAACGCAGCATTCCAATTAACATTATATCCGATATAGTCCTCTTACTTGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAAATAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACACACTTCTTATACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTAAGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGC < 1:982940/273‑1 gctcatccgatgtGGTTTGTGGATATTAACGCTGGGCATTGGGGGGAATGGACTCAGAGATGTGATCAAATGGGCACGCAGGAATACAATTATCATTATAACCGCTATAGTCAACTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAAATAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTAACTGCTTAGACTTGTGTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCA < 1:191054/287‑1 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ATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAAATCACTTCTTAAACTTGTTTATTCT > 2:560051/1‑172 ACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGn < 2:744906/55‑2 atagttaaatattttGTTTTATCTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAAATAATTTTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGATGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATG < 2:200487/286‑1 attAGAAGTGAGTTTTAACTAACTTCTTAAACGTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACG < 2:250187/298‑1 AGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATAAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCCATTATCTCATTATTTAGATGTAAGTTt > 1:1198574/1‑300 aAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACGTTAG < 1:400340/300‑1 aAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACGTTAG < 1:780663/300‑1 GAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCAAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTAAAAATTAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCACATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTAATTATGTAGATTAACGTT > 1:399711/1‑299 AGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCACATCAGACCTTTCAGTAACCCTGCTTCAATTATCTCAGTATGTTAATGTACGTTAGA > 2:598230/1‑300 GTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGAGTTAATATCAACAAACCAAAAGCTCGTTTTTTATATGATATCAAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTATGGAAAAAATTCCCATAAGACATTTCAGTGACCCAGCTTCTATTATCTCATTATGTAGTTGTATGTTAGAc > 1:1152448/1‑299 aAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTTTTTATTCTTAATACATTATATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATGGAGATGCTGCCTGACCATATGATCACATCACTGAGTCCTATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGATGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTGTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACGTTAGAAAAC < 1:1436729/300‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCAAAAAGACCTTTCAGTGACCCAGCTTCAATTATCACATTATGTAAATGTACGTAAGAAAAtt > 2:1388380/1‑299 GTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAACTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCAATCAGACCTTTCCATGACACTGCCTCAATTATCTACTTATGTAGTTGTAATTTAGCAAACTC > 1:662627/1‑301 TTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTC < 2:131861/273‑1 TTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTAAATTATCTC > 1:131889/1‑273 GGCTAAGAGGGGCATTGGAGTTTTCTAACGTACATCTACATAATGAGATAATTGAAGCAGGGTCACTGAAAGGTCTGATGGGAATTTTTTCCACACTTTTCCTCTATTTTTCACTATTTTATATAGCATATAAAAAACGAGCTTTGGGTTTGTTGATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3797921‑3798233‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taagaagtgagttTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATGATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAGTGAAAAATAGAGGAAAAGTGTGGAAAAAATTCCCATCAGACCTTTCAGTGACCCTGCTTCAATTATCTCATTATGTAGATGTACGTTAGAAAACTC < NC_000913/3798235‑3797938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |