| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 164 (0.750) | 94 (0.660) +GGGATGAGAAGCCCCGACCGGGGTTCGACAACTGGCGACAGCCAGTTGGACAGACCGTGAACGCAGTGAGCGGGCTGCCCGCAGGGCGAGCGAAGCGAGTC |
5/376 | 21.7 | 43.1% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097583 | 217 (0.990) | noncoding (70/88 nt) | serX | tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACAC‑CTCACCAAATTG‑TCGTTCCTGTCTTGCTGGAACGGGCGCTAATTTAGGGAAATCATGACCTGAGGTCAACAAACTTTTTGAAAAAATCGCGCGTTTATTCAAACTTCAATCAATGTGTGGTTTTAATAAGCGAAATCTGCTTTTTTTGCCACCGACCACGGATTTGTTATGCTGGTGGCCTTTGTAGATCATAACGATAAGTGCGAATAAATTTCGCACAACGCTTTTCGGGAG > NC_000913/1097285‑1097880 | ccccGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATCTACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTCCGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGG‑GGGGGGGTGTCGAACCCCCGATACGtt > 2:1880332/1‑301 (MQ=255) ccGGTCGCGCCGTCTCATCCCCCCGGTGTGTGAAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAAGATGGCGGTGAGGGGGGGATGGACTCGCTTCGCGCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGc < 2:1228185/301‑1 (MQ=255) ggggCTTCTACTCCCCCGGGGGTGTGCAAAATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGGTCTTCTTTAAAGATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACGCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGtata < 2:276876/301‑1 (MQ=255) cTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATCTACGAAAAAAAATCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGGTGA‑‑GGGGGGATTGGAACCCCCGTTACAtttgcgttaacccc > 2:1761028/1‑289 (MQ=11) cccccGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGTTCCCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACCGTCTGTCCAACTGTCTGTCGCCAGTTGTCGAATCCCGGTCTGGGCCTCTCATTCCCCCCGGTG‑GTTCAATAAACGGAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTGTTCTTTAAATATGGA‑TGGGA‑TGGGGGGTGTTGAACTCCCgcgtactttccggttgactccactcc > 2:1817999/1‑273 (MQ=11) ccccGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATAAGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GTGGGGGGGTCGAAACCCCGATAAGTTGCCGTATCAACACTCTcccgcc > 2:368619/1‑297 (MQ=255) ccatgttcaaaccaagagccctagaactagTACGAGCTGTTCTTTACCTCAGGCGGCGGGAGGAGGCTTGACCCTCTGCGCTCGCCCGGCGGGCGTCCCGCACACTGCGTTCTCGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGTGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAg < 1:724396/272‑1 (MQ=17) aaataatagAAAAAAACGGCCTTGTTTTCGTAGGTGTTTTTCTTTAATTATGGCGGTGGGGGGGGGTTTGACTCGCTTCTGTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAg < 2:1149268/293‑1 (MQ=17) aaagataCGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAg < 2:658589/297‑1 (MQ=255) aagacggaaaacgtaGCCCGTACTTTCGTACTACGTCTTCGTGCAGTCTGGAGTGGCGGGTGCGATTGACTGCCTTCGCCCGCCCTGCGGGCGGCCCGCTCTCTGCGTTACCGGTCTGCCCAACTGGCTGGCGCCAGTTGTCGAACCCCTGTCGGGGCTTCTCA‑GCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGcc < 1:1438592/287‑1 (MQ=17) 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aaaaaGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTCTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTTCGCGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTTA‑AGTGGGGATTTCAACCCCCATTCATTTTCCGTGTCTACACTTTCCAgactgggtcctcaagcccatccgaacc > 1:1843856/1‑275 (MQ=11) aaaGCCCGTACTTGCGTACAAGCTTTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCATTAAATATGGC‑GGTGA‑‑GGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACAC‑CTc < 2:756206/301‑1 (MQ=255) gctcgtacgaaagTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTTAGCCAATCGGACCC‑CTCAc > 2:40281/13‑301 (MQ=255) ccGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGAC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACCCTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGAAAC‑CCCAcc > 2:1110097/1‑300 (MQ=255) cTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTAGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTTGACCCCCCGTTACGTTTCCGTAGACCCACTTTCCACTCGTGCCCTTTCACCCCCTCGGCCAC‑CTCAccccattt > 2:1350491/1‑295 (MQ=14) aCGGGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAgg < 2:787613/257‑1 (MQ=255) aGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGGGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGGTGCCGTAAACAAACTTTACAGGCGTTCTCCTTATGCCACTCTG‑CACACTCACCAAATTG‑TCGGTCCTGt > 2:1784424/1‑301 (MQ=14) ctctTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCCATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATTTC‑GGGGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATAAGTTGACGTCTACAAATTTTACAGGATGTCTCCTTCCGCCACGTGGACAC‑CCCACCaacatttcggttctgttt > 2:1294211/1‑285 (MQ=14) tttAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCCATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGCGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCCACCCCCAGCTCCGTTGCCGTATACCCACTTTCCAGGCTGGCCCCTTCACCCAATCGGACAC‑CTCCCCAAATTC‑TTGTTCCTCTTTTGCTgt > 1:63627/1‑300 (MQ=14) 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gggggTTTCGAACCCCCAATACGTTGCCGGATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACAC‑CTCACCAAATTG‑TCGTTCCTGTCTTGCTGGAACGGGCGCTAATTTAGGGAAATCATGACCTGAGGTCAACAAACTTTTTGAAAAAATCGCGCGTTTATTCAAACTTCAATCAATGTGTGGTTTTAATAAGCGAAATCTGCTTTTTTTGCCACCGACCACGGATTTGTTATGCTGGTGGCCTTTGTAGATCATAACGATAAGTGCGAATAAATTTCGCACAACGCTTTTCg < 2:23756/301‑1 (MQ=255) ggagttCGAGCCCCCGATAACTTGTCATATTCACACGTTCCAAGCGTCATCCCTCAGCCACTCGTACAC‑CTCCCCAAAGTG‑TCTTTCCTGTCTGGCGGGAACGGGCGCTAATTTAGGGAAATCATGACCTGAGGTCAACAAACTTTTTGAAAAAATCGCGCGTTTATTCAAACTTCAATCAATGTGTGGTTTTAATAATCGAAATCTGCTTTTTTTGCCACCGACCACGGATTTGTTATGCTGGTGGCCTTTGTAGATCATAACGATAAGTGCGAATAAATTTCGCACAACGCTTTTCggg < 1:1922870/297‑1 (MQ=255) aTTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACAC‑CTCACCAAATTG‑TCGTTCCTGTCTTGCTGGAACGGGCGCTAATTTAGGGAAATCATGACCTGAGGTCAACAAACTTTTTGAAAAAATCGCGCGTTTATTCAAACTTCAATCAATGTGTGGTTTTAATAAGCGAAATCTGCTTTTTTTGCCACCGACCACGGCTTTGTTATGCTGGTGTCCTTTGTAg > 2:1021161/1‑253 (MQ=255) | TCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCA‑TCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACAC‑CTCACCAAATTG‑TCGTTCCTGTCTTGCTGGAACGGGCGCTAATTTAGGGAAATCATGACCTGAGGTCAACAAACTTTTTGAAAAAATCGCGCGTTTATTCAAACTTCAATCAATGTGTGGTTTTAATAAGCGAAATCTGCTTTTTTTGCCACCGACCACGGATTTGTTATGCTGGTGGCCTTTGTAGATCATAACGATAAGTGCGAATAAATTTCGCACAACGCTTTTCGGGAG > NC_000913/1097285‑1097880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |