New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 859197 | 259 (1.160) | intergenic (‑136/+16) | ybiU/ybiV | DUF1479 family protein/sugar phosphatase; fructose‑1‑P/ribose‑5‑P/glucose‑6‑P phosphatase | |||||
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Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
CCCTGTGCTTTGAGTGCGTTGATTTCAGCCACTCGCGTGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATTAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCGCAAAGGAATAACGCGCCATTTTCAGCATCTCCGCATCGTTACCGCTGTCGCCAATCGCTACCACATTTTGCGGTGACAGATCCCAGCGTTTCAGTAACCGCGAAATACCGTTTGCTTTATGTAGACCGGGAATAATCAGGTCGATAAAGCCAAA > NC_000913/858892‑859491 | cccTGTGCTTTGGGTGGGTTTATTTCCGCCACTCGCGGGGCAATTTCATCGCTTAGCTGATTAAAGATCGGCTGGGCGTCGCCCAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAgc < 1:1228078/301‑1 (MQ=255) tgCTTTTGGTGCGTTTATTTCAGCCACTCGCGGGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATGAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGCGCAc < 2:1843449/300‑1 (MQ=255) tttagttGCGTTAATTTCAGCCACACGCGTGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATTAAAGGTCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCGTTGTGATCGGCAAGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGCGCACGGc < 1:187157/294‑1 (MQ=255) ggggTTTATTTCAGCCACGCGCGTGTCAATGTCATAGCTTAGCTGATTAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAgccgtgcgctccggt < 1:1701498/297‑14 (MQ=255) aTTTCAGCCACTCGCGTGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATTAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAgccgtgcgctccggtttcgatcg > 2:1422677/1‑280 (MQ=255) tttCAGCCACTCGCGTGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATTAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGAGCACGGATCCGGTAGAGAGGtg > 1:583583/1‑300 (MQ=255) agccactatgggtgCAATGTCATCGCTTAGGTGATTAAAGATCTTCTGGGCGTCTCCAAGGTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCt < 1:21238/288‑1 (MQ=255) 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gAAAA‑CCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAATGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCGCAAAGGAATAACGCGCCATTTTCAGCATCTCCGCATCGTTACCGCTGTCGCCAATCGCTACCACATTTTGCGGGGAAAGATCCCATGTTTTCAGTCACCGCTAATTACCTCTTGTTTTACGTATATCGGGATTAATCAGGttg > 1:1278144/1‑298 (MQ=255) cGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCGCAAAGGAATAACGCGCCATTTTCAGCATCTCCGCATCGTTACCGCTGTCGCCAATCGCTACCACATTTTGCGGTGACAGATCCCAGCGTTTCAGTAACCGCGAAATACCGTTTGCTTTAtcgacctgattattcccggtctacataaagc < 2:1759359/301‑31 (MQ=255) gatcgcACGGTGCCGTTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTTTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGGTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCGCAAAGGAATAACGCGCCATTTTCAGCATCTCCGCATCGTTACCGCTGTCGCCAATCGCTACCACATTTTGCGGTGACAGATCCCAGCGTTTCAGTAACCGCGAAATACCGTTTGCTTTATGTAGACCGGGAATAATCAGGTCGATAAAGCCa < 2:936825/298‑1 (MQ=255) | CCCTGTGCTTTGAGTGCGTTGATTTCAGCCACTCGCGTGGCAATGTCATCGCTTAGCTGATTAAAGATCTGCTGGACGTCGCCAAGCTGCGCCCGCAGCGCGTGCTTCATCTGACGGATAGCTGCTTTGTGATCGGCAGGCAATGTGTCGCTGGTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGT‑ACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAA‑CCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCGCAAAGGAATAACGCGCCATTTTCAGCATCTCCGCATCGTTACCGCTGTCGCCAATCGCTACCACATTTTGCGGTGACAGATCCCAGCGTTTCAGTAACCGCGAAATACCGTTTGCTTTATGTAGACCGGGAATAATCAGGTCGATAAAGCCAAA > NC_000913/858892‑859491 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |