New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
TTTTGTTCGCCAGAGCCCGGGGGTGCAGGGGGCGGCGGCGATTGGCCGCCCCCTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATG‑AATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACAATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGACCAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGT‑CAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACA > NC_000913/915173‑915769 | ttgttttCGCCATAGCCCGGGGGTGCAGGGGGCGGCGCCAATTGGCCGCCCCCTGCGCGCTCCTCGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCAGGAAAGGAGCGCAACAAGACGATG‑AATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACAATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAAcc < 2:1199592/295‑1 (MQ=255) 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aaGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGACCAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCCCCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAAAAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAACAAAAACCGCTGGCTGCCGCGT‑CAAACCCCGTTTTACCAATGGCCACTaaaccacccagtccac > 2:524119/1‑288 (MQ=255) tAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGACCAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACAAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGT‑CAAAACCCGTTTTACCACTGACAATTAAATAAAGCAGCGCCGCTGc > 2:1258306/1‑301 (MQ=255) aaCCGAGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGAGAATCAGGATTAAGGCCAGACCACTAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGT‑CAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGcaaca < 1:700521/301‑1 (MQ=255) | TTTTGTTCGCCAGAGCCCGGGGGTGCAGGGGGCGGCGGCGATTGGCCGCCCCCTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATG‑AATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACAATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGACCAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGT‑CAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACA > NC_000913/915173‑915769 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |