New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2900306 = | 273 (1.190) | 9 (0.040) | 9/548 | 25.4 | 3.4% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
? | NC_000913 | 2900346 = | 253 (1.170) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
ACAGCAAGCAGCGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTACTTTTCTC‑TTTTTTTTGTCTATTACAAATGGGAATACGATATGCAACACAACTC > NC_000913/2900007‑2900605 | acaGCAACCCGCTATAGTCTTCGTCGGCTCGCCTATGGCGGTGATACCCACCTTCATGAAGTCCACCTCAAAACCCTGTTTTTCAATCATTCCCTTTGTTTCGCCGTTATTTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAaaag < 1:1751939/301‑1 (MQ=255) agcGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGACCGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCACCAATCTCCGTAAGGCAAAAAAaaagaaagtaaa > 2:314882/1‑296 (MQ=255) agcGAGGATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAAc < 2:2023760/301‑1 (MQ=255) tcttctGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCATCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTCccccac > 1:900692/1‑299 (MQ=255) cttctGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAAAAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATACAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATGCGATTGACATAATTAGCTCCAATCTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGGAACTTcccacc > 2:1776075/1‑297 (MQ=255) ttctGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TAAGAACGCATTGAACGATTCGATTGACATAGTGTGCTCCATTTTCCATAAGGCAAACAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCagcg > 2:1431926/1‑301 (MQ=255) acgatctcaccTTCTTCGATTATACCCACCTGCATGAAGCCCACCTCATCACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCAAGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCgag < 2:928291/291‑1 (MQ=255) cgcCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCAAGGCAAATGCCTGGCTTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATAGCGGTTTTACCTTTCAGGGTGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCAATTATAGATTCGATTGAGTTAGTTAGGTCTAATTTCCGTAAGGTAAAAAAAAAGAAAGGTaaaaacaccagcgaaagagcgc > 1:928042/1‑280 (MQ=255) gcCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGCCCAACGCAATGGCAAATGCCTGTCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTCCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAACAATCCAT‑TCACAATCCCTTGATCGATTCGTTTGATTTAGTTGTCTTCATTTCCCGTATTGCAAAAAAAAAGCAAGTTAACttacacctcagatgggaggtt > 1:510806/1‑282 (MQ=255) ccTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCACAGCGAGAGGGAAGtt > 2:982550/1‑300 (MQ=255) 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ccccgttgatcaatgcctccTCCACTCCCTCTTTTTGAATCATTGTCTTGGTTTCACCGTTAACTTTGACGAACATAAGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCCACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACCATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATGGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAGGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTAtctc < 2:890294/283‑1 (MQ=255) ccACCTGCATGAAGTCCCACTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTTTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTAtctc < 1:1123829/301‑1 (MQ=255) cccttctaTGAAATCCACCCCAACACCCTGTTGTTCAATAATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTAtctc < 1:1481038/293‑1 (MQ=255) aCCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCCTGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGTTTGATATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAATGAAAAAAAAAAGAAAGGAAACTTCCCACGCGAGAGGGAGATTACCTTTCTCATTAtctc > 1:1690846/1‑299 (MQ=255) ccTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGAAAGTTACCTTTATCATTAtctacgg > 1:1174041/1‑297 (MQ=255) ccTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGAAATTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACATTTCTCATTATCTCggg > 1:120720/1‑301 (MQ=255) 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cacCCTGTTTATCATACATTTCGTTTTGTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGTTATTTCCTCCAGCTTTGGCCAACGCCATGACAAATGCCTGGCCTAAACCGCTCTTCCCACC‑GGGAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGTTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGc < 2:1787608/301‑1 (MQ=255) tGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCGGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGacg > 2:1876848/1‑251 (MQ=255) tttCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACC‑GGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCAT‑TGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGc < 2:120753/300‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |