| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 569,043 | IS5 (–) +4 bp | coding (142‑145/1527 nt) | ybcK → | DLP12 prophage; putative recombinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 150 (1.280) | 111/598 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 569046 | 0 (0.000) | coding (145/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 111 (0.940) | 75/600 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 569043 = | 0 (0.000) | coding (142/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GCACCCATTTCGCATCATCAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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TCGCACCTTCCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAAGATAATAATCACTATTTACCTTTAACCATTCAGCAATAAGTCTTCTCTGTCGGTTTAATGAGTCGCCAGACATCTGACCTGGTGATGAAAATCGCATATATGCTATGGCTTTTTTCATGGTGACACCTGCTAACGTATGCTTTTATAAACCTTAGTGGTGGGATATAATTTTTGTTTATTTTTTATTTAAAAAGACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTT > 1:464063/1‑301 CCTTCCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAAGATAATAATCACTATTTACCTTTAACCATTCAGCAATAAGTCTTCTCTGTCGGTTTAATGAGTCGCCAGACATCTGACCTGGTGATGAAAATCGCATATATGCTATGGCTTTTTTCATGGTGACACCTGCTAACGTATGCTTTTATAAACCTTAGTGGTGGGATATAATTTTTGTTTATTTTTTATTTAAAAAGACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTTGAAAG > 2:1104650/1‑301 CCTTCCCTAAATCTTCAAATGTTATGGTAACAAGATAATAATCACTATTTACCTTTAACCATTCAGCAATAAGACTTCTCTGTCGATTGAATGAATCACCAGACATCTGGCCTGATGATGAAAATCGCATATATGCTATGGCTTTTTTCACGGTGACACCTGCTGACGTATGCTTTTATAAACCTTAGTGGTGGGATATAATTTTTGTTTATTTTTTATTTAAAAAGACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCGATTTACTTACGCCATAATCTTGAAAG < 2:1134903/301‑1 GCACCCATTTCGCATCATCAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274254‑273955‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAAGATAATAATCACTATTTACCTTTAACCATTCAGCAATAAGTCTTCTCTGTCGGTTTAATGAGTCGCCAGACATCTGACCTGGTGATGAAAATCGCATATATGCTATGGCTTTTTTCATGGTGACACCTGCTAACGTATGCTTTTATAAACCTTAGTGGTGGGATATAATTTTTGTTTATTTTTTATTTAAAAAGACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTTGAAAGC < NC_000913/569046‑568751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |