New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1096961 = | 107 (0.910) | 45 (0.520) | 15/440 | 7.4 | 37.3% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
? | NC_000913 | = 1097503 | 73 (0.850) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACT > NC_000913/1096663‑1097258 | tgactggagttcagacgtgtgctcttccgATCTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCAccc < 1:352490/273‑1 (MQ=255) tATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCgg < 2:335582/300‑1 (MQ=255) atgggCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtg < 1:728576/298‑1 (MQ=255) ggCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtgtg‑t > 2:642974/1‑301 (MQ=255) cAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGc < 2:417609/301‑1 (MQ=255) aCGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTGTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTAGTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCaa < 1:575632/301‑1 (MQ=255) ggTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTa > 1:471716/1‑300 (MQ=255) gTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATTACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTa > 2:209061/1‑299 (MQ=255) gTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCCTTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGTCAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCACTATACGAAAAAAAAGACCGTa > 2:66965/1‑299 (MQ=255) gTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTAc < 2:1212205/300‑1 (MQ=255) 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tctcTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGTATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTaa < 2:254466/298‑1 (MQ=255) ctGCTATGTAACGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTATCAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAACGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTaa > 2:1189479/1‑301 (MQ=255) cTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGTATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTaaaga > 1:254469/1‑299 (MQ=255) tACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATggag > 1:302354/1‑299 (MQ=255) gCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TAAGGCGGTGAgg > 1:937642/1‑301 (MQ=255) cTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAggg > 1:264695/1‑301 (MQ=255) 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aCTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTg < 1:209063/301‑1 (MQ=255) cTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTTTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACTGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAA‑ACCGTTCTTTCGTACGGGGTCTTTTTTAAAGTTTGCGGGGGAGGGGGGGAtcaa > 1:1002480/1‑298 (MQ=255) cTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGATGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGTTGAGGGGGGGAttat > 2:309591/1‑299 (MQ=255) 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cTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCCGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCCCCACTTGTCGCCTCCCGGTCTGGGCTTCTTATCCCCCCGGGCTTTGCTATCAACA‑CCATCACAGCCTTTACTTTCGT‑ACGACCTCTTCTTTACATATTGACGTGAGTGGGTGACTGTCTGCCTtcgctcgtc > 2:691542/1‑298 (MQ=14) gACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCgg < 1:312607/300‑1 (MQ=39) agagTGGGGGGGGGCACCC‑GTGTGATGAAGAAAAGGAAAAAAAAGCCCGTACTATGGTACGAGTTCTTCTTGAAA‑GACGGCGGGGAGGGGGGGATTGTCCCACTTTGCGCGCCCTGAGGGCAGCCCGCTCGCGGCGTGGAAGGTCGGTCCGACGGGTGGTCGCCAGTGGTCGACCCCCGGTGGGGGCTTCGCAGCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCg < 2:659581/296‑1 (MQ=11) aCGTGGGCGGTGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGTTCTCTTCTTTAGT‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTTACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCATTTGTCGCCCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCg < 1:359308/298‑1 (MQ=255) cgggggCGGGGGCACCCGGGGTG‑TGCAAAATAAGAAAAGAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑GATGGCGGGGAGGGGGGGATTGACACGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCGCTGCGTTCACGGTCGGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGc < 1:309595/297‑1 (MQ=255) tGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCTAACTGGCTGCCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑AAGAGCTCTCCTTTAAATATGGCGGTGCGTGGGGGATTCACTCGCTTTGCTTGCCCttccgtcag > 1:632154/1‑292 (MQ=11) ggCGGGTGCACCGGGGTTT‑GGGAATATACGAAAAAAAAGCCCGTCCTTTCGTACGGGCTTTTCTTTAAA‑TATGTCGGGGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTCGTCGACCCCCGGTCGGGGCTGCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGcc < 2:504942/300‑1 (MQ=11) gggggCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGc > 1:834513/1‑300 (MQ=35) cACCCGGTGTG‑TGCAATATCCGAAAAAAACGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGTGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACt < 1:746037/300‑1 (MQ=18) | CGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTG‑TGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAA‑TATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGT‑ACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACT > NC_000913/1096663‑1097258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |