New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 534223 = | 106 (0.900) | 6 (0.050) | 6/586 | 14.8 | 5.9% | coding (308/1782 nt) | gcl | glyoxylate carboligase |
? | NC_000913 | 534336 = | 88 (0.770) | coding (421/1782 nt) | gcl | glyoxylate carboligase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
GGTATTCGTCACATTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTCTGGTCGTCCGGGTCCGGTACTGGTGGATTTACCGTTCGACGTTCAGGTTGCGGAAATCGAGTTTGATCCTGACATGTACGAACCGCTGCCGGTCTACAAACCTGCTGCCAGCCGTATGCAGATCGAAAAAGCTGTAGAAATGTTAATCCAGGCCGAACGTCCGGTGATTGTTGCCGGGGGCGGGGTAATTAATGCTGACGCAGCTGCACTGTTACAACAGTTTGCTGAACTGACCAGCGTTCCGGTGATCCCAACGCTAATGGG > NC_000913/534039‑534634 | ggTATTGGTCAAATCGTGGCGCGTCATGGGGAAGGTGCTTAGGAGAGGGGGGAAGGTGGTAACCCAGGAAGGGCAGGGAATATCGGCGTATGGCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGAAAATGAGCACAGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATAGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAAGGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTcgc < 2:170854/300‑1 (MQ=255) caTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAACGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAg > 1:593624/1‑301 (MQ=255) ttCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGc < 1:508045/301‑1 (MQ=255) cgcgTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATCTCa > 1:728896/1‑301 (MQ=255) tCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCt < 2:995457/300‑1 (MQ=255) aTGTGGAAGTTGCGTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTGCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCTCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGAt < 2:593617/301‑1 (MQ=255) tgtgcgaagcaccttccacaTGACGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATg > 2:1040574/17‑301 (MQ=255) tgtgGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCCGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGGTACAGTTTGTTAAGCGGGCCTGGTGCCTCGCGTTCTGCAACAAGCATTTTCCCCGATg > 2:446280/1‑301 (MQ=255) gtgGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACTCGCGCAACGGCAGGGAATACCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTCTTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATGTTCAGGCTGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGCTACTGTTCGTGAAGCGGCTGTGGTTCCTTGCGTGCTTCAACAGGCCTTTCACCTGATg > 2:255471/1‑300 (MQ=255) gtgGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATg < 2:445462/300‑1 (MQ=255) ggAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTTCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGt > 1:396001/1‑301 (MQ=255) aGGTGCTTGGCACATGGCAGAAGGTTCTCCCCGCGCAACGGCAGGGAATTTCTGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCCCGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTc < 2:1169498/300‑1 (MQ=255) cGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTTTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAACCCGGTCAGCAAAACGGCGGTTCCAGTTCGATAAGCGGCGCTGGTTCCTCGCGTTCTGGCATCGCCATTTTCCCTTATTCGTTCTTgtcgtc > 2:317315/1‑300 (MQ=255) cacaTGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTCTGGTCgtccgg > 1:53388/1‑301 (MQ=255) ggaggAAGGTTAGACCAGCGCAACGGTAGGCAAAATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCACGCCCAATTCCGCTCCTGCCGACTCCATTCCTATTCTGTGTTCTACAGCCCAGGTCCCGTGTGTCTTTCTGCACACAGAAGCTTCTCAGGCCGCTGTTATTGAAGCAATTGCCATATCGGTCAGCAACACGGCCGATACAGCTACGGAAGCGGCGGCGGTGCCTGTCGGGCTGCAAACGGAAATCTACCGAGTGCGGTCTGGTGgtccgggtcgg > 2:478290/4‑299 (MQ=255) gCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCCTTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGGGGTGCTGGTTCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTCTGGTCgtccgggtccgg > 1:247017/1‑301 (MQ=255) gCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCTCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTCTGGTCgtccgggtccgg > 1:865593/1‑301 (MQ=255) gCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTTACAGTTCGTGAAGCGGCGCTGGTGCCCCGCGTGCTGCAACAGGCATTTCACCTGATGCGTTCTGGTCgtccgggtccgg > 2:542861/1‑301 (MQ=255) ggAAGGTTATACCCGCGCAACGGCAGGGAATATCGGCGTATGTCTGGGGACTTCCGGTCCTGCGGGCACGGACATGATCACCGCGCTCTATTCCGCTTCTGCTGATTCCATTCCTATTCTGTGCATTACCGGCCAGGCACCGCGCGCCCGTCTGCATAAAGAAGATTTTCAGGCCGTAGATATTGAAGCAATTGCTAAACCGGTCAGCAAAATGGCGGTGACAGTTCGTGAAGCGGCGAAGGAGACTCGCGTGCTGCAACAGGAGTTTCAACAGATGCGTTCTGGTCGTCCGTGTCAGGtg > 1:1037218/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |