New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1870243 = | 111 (1.060) | 4 (0.040) | 4/580 | 14.7 | 3.6% | intergenic (+5/‑142) | yeaH/yeaI | UPF0229 family protein/putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
? | NC_000913 | 1870272 = | 108 (1.070) | intergenic (+34/‑113) | yeaH/yeaI | UPF0229 family protein/putative membrane‑anchored diguanylate cyclase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TTGAGCTTTTAATTTTTGTGTACCCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1870552‑1870243 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggctgatTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTT > NC_000913/1870272‑1870571 TTGAGCTTTTAATTTTTGTGTACCCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGAC < 1:291883/301‑1 cctacacgacgctcttccgatctTAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTG < 2:1049477/278‑1 AGCTTTTAATTTTTGTGTACCCAAAGAAACCATAAAAAGGAGGGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGGGGTATAAAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCAAGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCT < 1:745383/300‑1 CTTTTAATTTTTGTGTACCCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGG > 1:18101/1‑300 CTTTTAATTTTTGTGTACCCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTG < 1:41065/299‑1 CTTTTAATTTTTGTGTAACCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTG < 2:717177/299‑1 TAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGagatcggaagagcacacgtctga > 1:1049493/1‑278 GGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTACATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAATTGATTCAGTCAACACGTATTTCAATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAACATTt > 2:949751/1‑300 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAAC < 1:949765/301‑1 TAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCAAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTACATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAAa > 2:277182/1‑300 TAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAAGCGATAATGACCTGGCTGATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCAAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTT < 1:277186/301‑1 CCTGGCTGATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTT < 2:975185/300‑1 ATTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAG < 1:43150/300‑1 TTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCCCTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGTTACACAACAATTAAACGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTT > 2:520849/1‑301 TTGAGCTTTTAATTTTTGTGTACCCATAGAAACCATAAAAAGGAGAGCAATGTGAGTGCTGGATTTTATTGATGGCAGAGATATATAGTTTTGACCAGGATCAATTTTCGTTAACGATAAAAAATATTTAAAGAATAACCCCATGGAAATACGTGTTGACTGAATCATTTTTCCGAATGATTGTTTTCTGGAACTAAATTATGTAAAGGTTATGCTGTCATATTTAAAGCGATTGTAAGCTAATGTATGTAATAAATGAGATAATTTACAGTAAGCTAAAAATCAGCCAGGCGATAATGACCTGGCTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1870552‑1870243 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggctgatTTTTAGCTTACTGTAAATTATCTCATTTATTACATACATTAGCTTACAATCGCTTTAAATATGACAGCATAACCTTTACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTT > NC_000913/1870272‑1870571 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |