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1:4082720/90‑1 ggACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCCGCCGCAGCATAGCGa < 2:4025674/193‑1 cATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGt > 1:1784189/1‑167 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAgtgg > 1:3371800/1‑63 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTATCCCCATCAACTGTGCTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATgg > 1:4352605/1‑147 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGcc < 1:5615506/79‑1 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGtt < 1:1413967/121‑1 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGt < 1:5425654/120‑1 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAAt > 1:3450541/1‑133 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAAtgc > 1:2295597/1‑172 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAAt < 2:5624598/170‑1 tCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGa > 1:3175718/1‑188 cccATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACcacac < 1:5206891/251‑1 cATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTAACCACACAg > 2:908099/1‑251 ccGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTCATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACACAGTTCTACAt < 2:5891336/251‑1 cGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACa > 2:3333117/1‑146 gATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCATGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACACAGTTCTACATc > 1:3574459/1‑250 gATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGACATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACACAGTTCTACAt > 2:5545035/1‑249 | ATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGA‑TGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACACAGTTCTACATC > NC_000913/582473‑582970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |