| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3461599 = | 321 (0.780) | 4 (0.010) | 3/310 | 20.5 | 1.4% | coding (132/510 nt) | gspH | putative general secretory pathway component, cryptic |
| ? | NC_000913 | 3461642 = | 276 (0.700) | coding (175/510 nt) | gspH | putative general secretory pathway component, cryptic | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
CGTTAATCCTGGTGAACATGGTGCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATGAAGAACTCTCAATTCATCTTCAGCCATTTAAACCTGATGACAGCAACCAGCCACAGGTTGTGATT > NC_000913/3461349‑3461845 | ggTGAACATGGTGCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTa > 2:1113490/1‑251 aaCATGGTGCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGc < 2:439769/251‑1 ggggaaTACGATCTGCTTGCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGGGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCAAAACAGCGGCGCGGTTTACCGc < 2:1349563/241‑1 gTGCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTCCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAgcgg > 1:577167/1‑232 gCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCCGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGGACTTg > 2:3854435/1‑251 gCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCAt > 1:149228/1‑250 gCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCAt > 1:3325763/1‑250 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1:1592542/1‑122 ctTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTtc < 1:1042443/127‑1 ctTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTAc < 1:3807448/155‑1 ctTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCg < 2:5503261/157‑1 ctTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGgcgc < 1:4657857/181‑1 tCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGc < 2:2457139/96‑1 tCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATgg > 2:5479267/1‑150 tCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATgg < 1:5480189/150‑1 acaTATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATc > 2:3739031/1‑167 caTATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATgaag > 2:1382879/1‑231 ggCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTAt > 2:1936650/1‑140 ggCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATgg > 2:2860825/1‑142 ggCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATgaaga > 1:3512973/1‑227 gCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATc < 2:3271014/110‑1 gCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATGAAGAACTCTCAATTCATCTTCAGCCAttt > 1:1331726/1‑251 cGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCAt > 1:4104979/1‑116 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cTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTAc < 2:2090342/123‑1 cgcgcgAACCAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATGAAGAACTCTCAATTCATCTTCAGCCATTTAAACCTGATGACAGCAACCAGCCACAg < 1:3188818/251‑1 aaaCAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCgg < 1:1642317/73‑1 aaaCAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCgg > 2:1642013/1‑73 aaaCAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTAc > 2:5047726/1‑111 aaaCAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATc < 1:4371256/127‑1 | CGTTAATCCTGGTGAACATGGTGCATACGATCTGCTTTCAGCAGGGCCCGATGGTGAAATGGGAACCGAGGACGACATCACCAACTGGGGTTTGAGCAAGAAGAAAAAGTAAGTCAGCGATGAATCAGCAACGCGGGTTTACCCTGCTGGAGATGATGCTGGTGCTGGCGCTGGTCGCTATCACGGCAAGCGTGGTGCTCTTCACATATGGCCGGGAGGATGTCGCCAGCACTCGTGCGCGCGAAACAGCGGCGCGGTTTACCGCTGCACTTGAATTAGCCATCGACCGCGCCACGCTCAGTGGTCAGCCTGTCGGTATCCATTTCTCTGATTCAGCATGGCGCATTATGGTACCGGGCAAAACACCATCAGCCTGGCGCTGGGTTCCATTACAAGAAGATGCCGCAGACGAGAGCCAAAATGACTGGGATGAAGAACTCTCAATTCATCTTCAGCCATTTAAACCTGATGACAGCAACCAGCCACAGGTTGTGATT > NC_000913/3461349‑3461845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |