New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
GCTGATGGGTCTGGCTGGCTGATATCAACGGTACAAGCCGAAAGTAAAAGAAAGCTGGGGAGAAACAGGCGGCAGTACGCCTTTGGTTTATCCATTTTATACAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTATATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATAGTGTGCGGAATACCGATCAGTTCCATATCAGCAAACATCACGCCCGGACGCTCTTTGCGGTCATCCAGCAGCACTTCGATACCTTGTGCACGCAGTTCGCTGTACAGTTTCTCAGCAAGCTCTTGTACGCGGAAGGATTTGTGCATGTTCATCGGCAGAATCGCCACCTGGAACGGCGCGATAGCGTCAGGCCATACGATGCCTCGTTCGTCGTAGTTC > NC_000913/216909‑217402 | gCTGATGGGTCTGGCTGGCTGATATCAACGGTACAAGCCGAAAGTAAAAGAAAGCTGGGGAGAAACAGGCGGCAGTACGCCTTTGGTTTATCCATTTTATACAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTATATTCGATATCGTCGTTGTCg > 2:5937759/1‑251 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GCTGATGGGTCTGGCTGGCTGATATCAACGGTACAAGCCGAAAGTAAAAGAAAGCTGGGGAGAAACAGGCGGCAGTACGCCTTTGGTTTATCCATTTTATACAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTATATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATAGTGTGCGGAATACCGATCAGTTCCATATCAGCAAACATCACGCCCGGACGCTCTTTGCGGTCATCCAGCAGCACTTCGATACCTTGTGCACGCAGTTCGCTGTACAGTTTCTCAGCAAGCTCTTGTACGCGGAAGGATTTGTGCATGTTCATCGGCAGAATCGCCACCTGGAACGGCGCGATAGCGTCAGGCCATACGATGCCTCGTTCGTCGTAGTTC > NC_000913/216909‑217402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |