| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 8 (0.020) | 3/326 | 21.0 | 1.6% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2468910 = | 479 (1.160) | coding (697/921 nt) | gtrB | CPS‑53 (KpLE1) prophage; bactoprenol glucosyl transferase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 516 total aligned reads displayed.
AAGAGAATGTTGGTGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAGTATCATTGTAT > NC_000913/2468662‑2469160 | aaGAGAATGTTGGTGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGGCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCGCTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCGCATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAggg < 1:2191190/251‑1 aTGTTGGTGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTg < 1:4697673/251‑1 tGTTGGTGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACATAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTgg < 2:1686725/251‑1 tGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGcc < 2:2319795/250‑1 tGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGcc < 1:2715602/250‑1 aTTTCAGGATGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTAGTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAggg < 1:5807854/236‑1 ttCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTANNNNANNCTTTTCCNNNNNNNCTCTTCGNNNNNNNACATACANNNNNNNAGTGGTannnnnnnn < 2:3396964/251‑9 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atatTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCat < 1:133592/225‑1 atatTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTa > 1:54939/1‑251 tatTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAg > 1:4219416/1‑251 aCTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTgg < 2:5787993/203‑1 aCTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGcc > 2:3908233/1‑208 aCTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGcc < 1:3908886/208‑1 tGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTgg < 2:5107859/198‑1 aaGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAggg > 1:67684/1‑167 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2:3285141/1‑144 ctctTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAagag < 1:5246287/235‑1 ggACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAg < 2:1355363/156‑1 gACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAga < 1:4313059/140‑1 gACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAgg > 2:5463938/1‑162 gACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATAcatc < 2:1129204/214‑1 gACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATAcatc < 2:5248484/214‑1 gACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAg > 1:1208875/1‑250 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGat < 1:1746994/91‑1 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGat > 2:1746689/1‑91 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCac > 2:3682638/1‑100 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGttt > 2:779989/1‑120 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAgatg > 2:2802844/1‑138 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAgatg > 2:2593018/1‑138 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAgatg < 1:2593449/138‑1 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAg > 1:2247329/1‑151 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAatat > 2:5339908/1‑165 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCacatacat > 2:1888476/1‑182 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCacatacat < 1:1888813/182‑1 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAAc > 1:2777460/1‑188 tacataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAagag > 1:2903500/1‑218 acataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCac > 2:4630455/1‑99 acataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACtt < 1:1004278/104‑1 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATAc > 1:2122010/1‑109 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAgatg > 2:5962628/1‑132 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAgatg > 1:2983613/1‑132 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAg < 1:966505/145‑1 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAgg > 2:3524253/1‑152 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAatat < 2:2238369/159‑1 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTg < 2:4916815/163‑1 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGAc > 1:720016/1‑166 gggTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCacatacat > 1:2050967/1‑176 | AAGAGAATGTTGGTGATTTCAGGCTGATGAGCCGTGATGTTGTCGAAAATATTAAACTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAGTATCATTGTAT > NC_000913/2468662‑2469160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |