| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3890075 = | 510 (1.230) | coding (1346/1416 nt) | tnaA | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 515 total aligned reads displayed.
CTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTGAACTGCTGCGTTTAACCATTCCGCGCGCAACATATACTCAAACACATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTT > NC_000913/3889828‑3890323 | gCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTGAACTGCTGCGTTTAACCATTCCGCGCGCAACATATACTCAAACACATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTAtt > 2:412195/1‑251 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gtgAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATgg < 1:1209341/232‑1 aaGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATtggt < 2:5428304/251‑1 agaACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGAc > 2:4316163/1‑181 atatTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGc > 1:4795590/1‑107 atatTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAc < 2:1620470/118‑1 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tatTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAgg > 1:5523548/1‑156 atTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGc < 1:2442525/218‑1 | CTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTGAACTGCTGCGTTTAACCATTCCGCGCGCAACATATACTCAAACACATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTT > NC_000913/3889828‑3890323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |