Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,101,734 | 0 | G→T | 13.4% | 50.5 ‑58.5 0.0 | 523 | Q132K (CAA→AAA) | csgF | curli nucleation outer membrane protein |
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (70/0): ref base (177/276): total (247/276) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.82e-26 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
GGGTTTAAATTGCCCGGTTTCGTCCTGAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTCACCATGCGGCCCGGTTTACCGGTATTAATATTCGACAGTAGCCCACCTAAAATTTGTGACTGGATGGCCTGAGTAAAGTTATCTAACGCTGAGGGTGTTTCAATACCAAAGTCATCGTTATAGCTCGGATCTTTATAAGAG > NC_000913/1101490‑1101981 | ggTTTAAATTGCCCGGTTTCGTCCTGAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTTAACCTCCCCTCCGGAACATGACGGCCAACAAAAG‑AAAAAAAAGCTGCATGATTTTTTTCCTTA‑TGAAACTGGGGCTTAAAAAAACGGTGA‑GAT‑AATTTTTaaaac > 1:2081945/1‑248 (MQ=255) gTTTCGTCCTGAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTAAGCATCCGCCCAGGAAAAAGACGGGAAACAAAAG‑AAAAAAACGCTGGATGATTATTTTTCTTA‑TGAAACAGGGGGTTAAAAAACGGGTGA‑GGT‑ATTTTTTAAA‑ACCGAAACCTgggggggg > 1:3162287/1‑245 (MQ=255) gTCCTGAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCCCCCCGGAACATGACGGCAACCAAAAA‑AAAAAAACGCTGCCTGATTTTTTTTCTTT‑TTAAACTGGGGGTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAACCCCGAAACC‑GGATGGTCGAGGt > 1:1634865/1‑251 (MQ=255) tCCTGAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGtt < 2:5382489/251‑1 (MQ=255) gAATGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTAAACATTCGCCCAAGAAAATGACGGGAAACAAAAGAAAAAAAGGGCGGCA‑GAATATTTTTCTTT‑TGGAGCCTGGGCGTAAAAAACAGTTGA‑GTTAATTTTTAAAA‑CCCAAAACATGGAGGGtgagggg > 1:4346848/1‑241 (MQ=255) aaTGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTcc < 2:2895126/251‑1 (MQ=255) aaTGTTGTATACCGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTc < 2:1634564/250‑1 (MQ=255) tccGAAACAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCGAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 1:2880233/250‑1 (MQ=255) aaaCAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 2:2064038/247‑1 (MQ=255) aaaCAAAGATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 1:134454/247‑1 (MQ=255) gATTTTACCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAACATCCCCCCAGTAAAAAGACGGCCACCCAAAG‑AAAAAAACGCCGCCTGATTTTTTTCCTTT‑TTAAGCTGGGGGTTAAAAAACGGTTGA‑GGT‑TTTTTTTAAA‑ACCCAAAACTGGATGGGGGAGGGTTTTTCGGGTTTTCGATCtttta > 1:237195/1‑243 (MQ=255) aCCCGTCGGCGCTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTg < 2:1817630/251‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTTAGCATCCGCTCCGTAACATGACGGCAACCCAAAG‑AAAAAAGCGCTGCATGATTATTTTTCTTT‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAAACGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑ACCGCAACCTTGATGGTCGAGGGTTGTCCGGTTTTATGATCTTTCCCGt > 1:425397/1‑236 (MQ=255) gcgcTGGCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGt < 2:425322/236‑1 (MQ=255) ggCAGATGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTTAACATCCGCTCAGTAACAAGACGGCAACCAAAAA‑AAAAAAACGCTGCATGATTATTTTTCTTA‑TGAAACTGGGGGTTAAAAAACGGGTGAGGTT‑TTTTTTTAAA‑CCC‑AAAACTGGGTGGTCGAGGGTTGTTCGGGTTTACGATCTGTTACGGTCAACTGGAATTTACCAtt > 1:124980/1‑249 (MQ=255) aTGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATc‑gcg < 1:3526091/248‑1 (MQ=255) aTGGGTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCgg < 2:124931/249‑1 (MQ=255) gTCAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTTAAAATCCGCCCCGGAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAAAAAGCGCCGCATGATTTTTTTTCTTA‑TTAAGATGGGGGTTAAAAAACGGGTGA‑GTT‑TTTTTTTAAA‑CCCGAAAACTGGAAGGGCGAGGGTTGTTCGGGTTTTCGATCTGTCACGTTCAAATGCAATTGACCATT‑CCGGGTGGCa > 2:5911874/1‑251 (MQ=255) cAAATCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAat < 2:3616763/251‑1 (MQ=255) aaTCTTTGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 2:3957004/208‑1 (MQ=255) ttGTAGCTCTGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTAAGCATCCGCCCCGTAACATGACGGCAACCAAAAA‑AAAAAAACGCCGCATGATTATTTTCCTTT‑TGAAACCGGGGGTTTAAAAAAGGTTTA‑GTT‑TTTTTTTAAA‑CCCGAAAACTGGATGGTCGAGGGTTTTCCggggtttctg > 2:5723457/1‑195 (MQ=255) ctctGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAatat < 1:4540439/249‑1 (MQ=255) tGAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCg < 2:3392835/251‑1 (MQ=255) gAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGGATCCGCCCCGTAAAATGACGGCAAACAAAAG‑AAAAAAGAGCTGCCTGATTTTTTTTCTTT‑TTGAGCTGGGGGTTTAAAAACGGGTGG‑GTT‑ATTTTTTAAA‑ACCCAAAACTgggt > 2:2977533/1‑166 (MQ=255) gAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 1:4644373/193‑1 (MQ=255) gAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGt < 1:5565348/203‑1 (MQ=255) gAGCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAACGCTGCCTGATTATTTTCCCTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAAACGGTTGA‑GGT‑ATTTTTTTAA‑ACCCAAACCTGGGTGGGCGAGGGTTGTTCGGTTTTTCGATTTGTCAAGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGGTGGCAATATCCACAATATAATAGt > 1:3422359/1‑251 (MQ=255) gCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAAAATGACGGGGAACAAAAG‑AAAAAAGAGGCGCCTGATTATTTTTCTTA‑TTAAGCCGGGGGTTTAAAAAAGGGTGG‑GGT‑TTTTTTTAAA‑ACCGCAAcc > 1:4737710/1‑161 (MQ=255) gCACGAGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTAAGCATTCGCCCAGTAAAAAGACGGGAAACAAAAA‑AAAAAAACGCTGCATGGATATTTTTCTTT‑TGAAGCTGGGGGTTAAAAAACGGGTGG‑GGT‑ATTTTTTTAA‑ACCGAAAACTGGATGGGCGAGGGTTGTTCGGTTTTACGATCTGTTACGTTCAAATGCAATTTAACATA‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATAGTTg > 2:3500928/1‑251 (MQ=255) aGGCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAAcc < 2:1883907/156‑1 (MQ=255) 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gCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAACATACGCTCAGTAAAATGACGGCAAACAAAAA‑AAAAAAAAGCTGCATGATTATTTTTCTTA‑TGGAACTGGGGGTTAAAAAAAGGGTGA‑GGT‑ATTTTGTAAA‑ACCGCAACCTGGATGGGCGAGGGTTGTCCCGGTTTTCTAAATTTCACGTTTAAATGGCAATGACCAAC‑GCGGGTGGCAAAATTGACAAAATaaaagctgggcaaca > 1:2659233/1‑238 (MQ=255) gCATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGGTTAAAATTCCCGCCGTAAAATTGCGGGAACCAAAAG‑AAATAAACGCCGCATGAGTATTTTTCTTATTTAAGACGGGGCTGAAAAA‑CGGTTGA‑GGT‑TTTTTTTAAA‑ACCGGAAACTGTATGGTTGAgggt > 2:3179704/1‑167 (MQ=255) cATTAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGc < 2:816440/221‑1 (MQ=255) tAATGTCGGTCTGGCGGCTTCTTTAGGCGGGGCGGTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTc < 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1:4415071/1‑111 (MQ=255) gTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGAt > 1:277893/1‑121 (MQ=255) gTTAAGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa < 1:1160785/146‑1 (MQ=255) aGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCaa > 1:5137996/1‑162 (MQ=255) aGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTCACCATGCGGCCCGGTTTACCGGTATTAATATTCGACAGTAGCCCa > 1:3236469/1‑250 (MQ=255) aGCATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTCACCATGCGGCCCGGTTTACCGGTATTAATATTCGACAGTAGCCCa > 1:4299890/1‑250 (MQ=255) cATCCGCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGtt > 1:3069272/1‑125 (MQ=255) gCTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTCACCATGCGGCCCGGTTTACCGGTATTa > 2:219158/1‑225 (MQ=255) cTCAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGa > 2:5527780/1‑134 (MQ=255) cAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑cc > 2:5276070/1‑95 (MQ=255) 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cAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCg > 1:5305774/1‑189 (MQ=255) cAGTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCGTTGGTCACCATGCGGCCCGGTTTACCGGTATTAATATTCGACAGTAGCCCACCTAAAATTtg > 2:625869/1‑251 (MQ=255) gTAACATGACGGCAACCAAAAT‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAATATCGACAATATAATCg < 2:1772368/187‑1 (MQ=255) gTAACATGACGGCAACCAAAAG‑AAATAAGCGCTGCATGATTATTTTCCTTA‑TGAAGCTGGGGCTTAAAAATCGGTTGA‑GTT‑ATTTTGTAAA‑CCCGAAACCTGGATGGTCGAGGTTTGTCCGGTTTTACGATCTGTCACGTTCAACTGCAATTGACCATC‑GCGGTTGGCAatat < 1:768379/173‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |