Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 3,745,371 | 0 | T→G | 16.9% | 10.0 ‑1.7 0.0 | 320 | W190G (TGG→GGG) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
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Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.81e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
CCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCTGCTTTCTATGCGCTGTTTGTCGCCACAGTTATTTACCGTGAAATGACCTTCGCCACACTTTGGCATGTACTCATT > NC_000913/3745121‑3745610 | cTTTCTGGTTCGGCCGTGGCGGATCCCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCtggtg < 2:731093/251‑1 (MQ=255) tttCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCCGGCCTGGTGATGGGCGCGACGCTGATGACTTCCtggtgg > 2:2439289/1‑251 (MQ=255) ttGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGc < 1:3212730/251‑1 (MQ=255) tACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAAtt < 2:5554031/251‑1 (MQ=255) ccgccgTTGCCGCTCTTCTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTAGCCGTTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTAccc < 1:5244311/251‑1 (MQ=255) ccgTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCtggtg < 2:1733155/220‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGGCTTTCTCCTCGGATGGTTGTTGGCGCAAAGCTGGTGGTTTTCCGGTGGGGGCCGGGCC‑CGTCCCCTACATTT‑CCCCGcc > 2:1206001/1‑250 (MQ=255) ccGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCGTTTCCCCCGGCATGATGATGGGGGCAACGCCGATGCGTTCCTGGTGGTGG‑CAGGCG‑CGTCGCCTTTATTTACCCCGCCAGcca > 2:589293/1‑249 (MQ=255) ccGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCtggtggt < 2:4375825/216‑1 (MQ=255) gCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGCTTATCCCTCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCCTGCACGACGTTTGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGTGGTGG‑CACGCC‑CGTCGCCCTTATTTACCCCGCCAGCcaaa > 1:5166995/1‑251 (MQ=255) aCTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCCTGCATGATGATTGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑CGGCGCCTTAAtttttcccccccgccaacaacaa > 2:5416397/1‑231 (MQ=255) gcgcCAGCTATCTGGTCACCCGGGCGGCGGGGTTGATTCCCTCTGGCGGCATTAGCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGGGGATTATCCACCAGTAAGCGGTTTATGGCGGGCATTGCCCCGGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATc < 1:2331416/245‑1 (MQ=255) gcgcCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCCTTATGATGGGGGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGG‑GCGGCC‑GGTCGCCTTTATTTAACCCCCCAGCCAAAAGCAAcacagcaagaaaacttgcc > 2:2294223/1‑232 (MQ=255) gcgcCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGcc < 1:1366565/204‑1 (MQ=255) ccAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCCGGGCTGATGGTGGGGGCCACCCTGGTGCTTTCCTGGGGGTGG‑CGgggc > 2:4204964/1‑192 (MQ=255) aCCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCCGGCCTGGTGATGGGCGCCACCCTGCTGCTTTCCTGGGGGGGG‑CCGGCC‑CGTCGc > 1:1016276/1‑185 (MQ=255) gcggGGCTGATTGCCTTTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCGTCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGGTGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAAttt < 1:2577991/185‑1 (MQ=255) gggCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGGTGATGGGCGCAACGCTGATGGTTTCCTGGGGGTGG‑GAGGCC‑CGTCGCCTTAATTTACCCCCcc > 2:1853310/1‑190 (MQ=255) gggCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGcc < 1:1853648/190‑1 (MQ=255) ctGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGGATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAAAGCTGATGCTTACCtgggggt > 1:2696674/1‑147 (MQ=255) ctGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCtggtggt < 2:2696235/147‑1 (MQ=255) cggcATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCCACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑GAGGCC‑AGGCGCCCTAATTTTCCCCCCCCGCAAAAAACAACGAAGCCGGGAAACTGGCACTCTTTTTTCTCCGGGATTTGGGCGGTGTttttttccgtgcatattt > 1:4372631/1‑238 (MQ=255) gcATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTAccc < 2:651389/167‑1 (MQ=255) gcATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTAGGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGAAACGCTGATGCTTCCCTGGGGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCatta‑t < 2:5202575/250‑1 (MQ=255) aaTTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGGGGGGG‑GAGGCC‑AGTCGCCCTTATTTTCCCCCCCCGCCAAAAGCAACGATGCCGGGAAACTGGCACTCTTTTTTCTCCGGCATCt > 1:932232/1‑209 (MQ=255) aaTTATCCCCCCTCCCATCCCTTTTATTATCTTCGGCTTTCCCAGCGGATTATCCATCAGAAGGCTTTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTCCCGGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCatta‑t < 1:5184285/237‑1 (MQ=255) attattCCCCCTTCCATTCCGTTTGTTATCTGGGGCGTTTCCAGCGGATTATCCAACAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCAAAGCGCTGATGCTTGCCTGGGGGTGG‑CAGGCC‑GGTCACCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGc < 1:5886269/167‑1 (MQ=255) ttattCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCTGGGATGATGATGGGGGCAAACCTGGTGCTTTCCTGGTGGGGG‑CAGGcc > 2:2776187/1‑134 (MQ=255) ttattCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGG‑CAGGCC‑AGGCGCCCTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTTTCTCCGGGATCTGGGCGCTGTTTCTTCCCGTCATCATTT‑TTGGCggggt > 2:2979522/1‑242 (MQ=255) 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1:4128313/1‑113 (MQ=255) gcgcAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:4097507/1‑113 (MQ=255) gcgcAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTcc > 1:1591174/1‑124 (MQ=255) gcccAACGCTGATGCTTCCCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCg < 2:5319726/168‑1 (MQ=255) ccgcACCGCTGATTCTTCCCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTATTTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCTGCTTTCTATGCGCTGTTTGTCGCCACAGTTATTTACCGTGAAATGACCTTCGCCacac < 2:4562022/245‑1 (MQ=255) caccGCGGAGGCTGACCGGGGGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCTGCTTTCTATGCGCTGTTTGTCGCCACAGTTATTTACCGTGAAATGACCTTCGCCACACTTTGGCAt < 2:5832094/248‑1 (MQ=255) aCGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttcttc > 1:4634590/1‑118 (MQ=255) cGCTGATGCTTCCCTGGGGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTAcccc < 1:4575339/160‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:2500928/1‑107 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:4735543/1‑107 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:860099/1‑107 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtc < 1:5511980/122‑1 (MQ=255) gATGCTTACCTGGTGGTGG‑CGGGCC‑GGTCGCCTAAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCg < 1:339812/161‑1 (MQ=255) gATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:339737/1‑103 (MQ=255) gATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCA‑AGTCCCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGttt < 2:2404491/151‑1 (MQ=255) gtgtttcccgggtggggg‑CAGCAC‑AGTCGCTTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCTGCTTTCTATGCGCTGTTTGTCGCCACAGTTATTTAc < 2:5117986/203‑1 (MQ=255) aTGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:976435/1‑102 (MQ=255) tGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:3323992/1‑101 (MQ=255) tGCTAACCGGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtca < 1:2257062/117‑1 (MQ=255) ttcccTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTc < 2:4221394/133‑1 (MQ=255) tcccTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCTTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTg < 2:4638047/120‑1 (MQ=255) tACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑GGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:149314/1‑97 (MQ=255) tACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTg < 2:2105044/122‑1 (MQ=255) tACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:2105418/1‑97 (MQ=255) ccTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCCCCTTATTTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCg < 1:4936383/153‑1 (MQ=255) ggtggtgg‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 2:4577317/1‑92 (MQ=255) ggtggtgg‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGttt > 2:1656109/1‑98 (MQ=255) ggtggtgg‑AAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGttt < 1:1656413/98‑1 (MQ=255) | CCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCCCCCTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGG‑CAGGCC‑AGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTA‑TTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCTGCTTTCTATGCGCTGTTTGTCGCCACAGTTATTTACCGTGAAATGACCTTCGCCACACTTTGGCATGTACTCATT > NC_000913/3745121‑3745610 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |