| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,226,255 | 1 | .→A | 2.7% | 2.6 0.0 ‑0.2 | 75 | intergenic (‑175/‑345) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein |
| Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/1): ref base (45/28): total (46/29) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.57e-01 | ||||||||||
GAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGATTACGGATTGATGA > NC_000913/1225969‑1226554 | gAGCGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGAGGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCCAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAATTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTTTC‑AATCAAACCATTg > 2:227501/1‑300 (MQ=255) tccgttgggATAACCGTAGGTTCTGCCGCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCGTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTTACATCCTGGCCTTAATCAAGTAGCTATTAATCATGGCCATCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTc < 1:325610/294‑1 (MQ=255) aCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCCCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATAAACCCATTGCCGTCGTCCTTTTTATTGTTCTTATTTACGCtt > 1:202812/1‑301 (MQ=255) gTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCGATTTATTCGGCGTAAAAGACTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGGC‑AATCAACACATTGCCGTCGTAATTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCttttt > 2:333245/1‑301 (MQ=255) ttCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTc < 1:57963/301‑1 (MQ=255) cTCATGCAGATGAACCAAAGATAAAGTGAAGCTATTGCCTTTAAGCTCGATTTGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCAcc < 1:119941/301‑1 (MQ=255) gtGAACCACAGATACAGTGTAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGTCGTGTTTGACATCCTGGCCTGACTCGATTAGCTATTAATCATCGCAAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAATGCGTGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCg < 2:202814/298‑1 (MQ=255) aaCCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGTCGTGTTTTACATCCTGGCCTTACTAAATTAGCTATTAAGCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCAGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGAc < 2:425212/300‑1 (MQ=255) caGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAACACATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTCCTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTTACTGCAt > 1:194755/1‑300 (MQ=255) taagatcgcgtggcttgttgtaactCCTGGCCTGACTCAATCACGTAGTAATCATCGCCAGCTCTCCATGATGTTCCGAAGTCTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGACAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATACATGTCGCGGATTCATATCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAAGCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGt < 2:327052/277‑1 (MQ=255) tttggattgtTTGACATCCTGGACTTATTCAATTAGCGATTCATCATCGCCAGCTCGCGATGATGTCTCCAACACTATAAGTCATGTTATAGGCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCTCATTTATTCAGAGTAAAATTCTATTCTGTGATAAATGGCGTTGATTCATATTCTAAAAATTTCCCTTGTC‑TATCATCCCACTGCTGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCATCCTAATCGTGACAGCATCTCCTGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGc < 2:137935/294‑1 (MQ=255) gtTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTACAAGTCTATTCTGTGATAACTGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATCCCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCCCACCCTATTCGTTACAGCATCTCCAGCCCTGTTTCAATATCACGTCTTGAGGCAAttgttt > 1:51892/1‑299 (MQ=255) ggCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCcgtcg > 1:417654/1‑191 (MQ=255) ggCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTCATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAATTATCCAGTATTCAGTCAATTTTCTTTTTTccccac > 1:70146/1‑300 (MQ=255) aCTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTACTCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCATTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAgg > 1:86489/1‑301 (MQ=255) cTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGTTGGTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGGCTAGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCACATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTATGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAAc < 1:227496/300‑1 (MQ=255) cTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGTTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGTCAAGTGTATTTTTTCACAACGCCAGGCTTTCTTaa > 1:327708/1‑299 (MQ=255) gTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTTAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCCTTTTTTGCGTCATCATTAAAg > 1:302770/1‑299 (MQ=255) gTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAg < 2:302778/299‑1 (MQ=255) ttCCGAAGACTATAAGGGATTTTAGAGTCTTGTGTATAGTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTGATTCAGAGTAAAATTCTAGTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTAATTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAAc < 2:397398/301‑1 (MQ=255) tCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATcc < 2:160205/224‑1 (MQ=255) tCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATcc > 1:160204/1‑224 (MQ=255) 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cTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTTCGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACATATAcc > 1:316326/1‑299 (MQ=255) cTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATAccc > 1:424664/1‑300 (MQ=255) cTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTAATTTTGCTTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCCCCCTAATCATGACCGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTAt > 2:125443/1‑221 (MQ=255) gCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGTCATAATTACAGAACAGATACCCGTTATCtt > 1:86768/1‑301 (MQ=255) aTGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCACGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCGTCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTCTTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCCAGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCCTCCTTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTat > 2:241075/1‑300 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCATGGTC‑AATCAACACATTGCCGTCGTCCTTTTGATTGTTCTTAGTTACGCTTACTTTTTCCGCACCCTAATCGTGAAAGCATCTCCAAGACTGTTTAAATATCCAGTCTTGATGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCAAGGATTTCTTAACTTTCCCTTTTTTGCGGCATACTTAACGAAAAGAAACCCACTATCTTTatt > 2:163791/1‑300 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCAAAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGAACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGAGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTCTCTTAatt > 2:278796/1‑300 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATAGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGATGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCACGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTTAGTCATCATTTAATCACAGATACCCGTTATCTTAata > 1:395959/1‑301 (MQ=255) ttATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATAACCTTGTC‑ACTCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACCGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGACAGTGCATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTCATTTTCAATTTTTTACGGCATCATTAACGAACAGATACCCGTTCTCTTAatat > 2:352478/1‑301 (MQ=255) 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atatTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCAATTTTTTGCGGCCTCATTAAAGCACAGATCCCCGTTCTCTTAATATCCGCCACAGACttt > 1:99917/1‑300 (MQ=255) tttaGGTAAGTACCCCTACCAATTATTCATAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGctc < 2:401273/298‑1 (MQ=255) ttaCCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCAAAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGaa < 1:278790/299‑1 (MQ=255) 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aaaTGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATCTCCAGTATTGAGGCCAGTGTATTTTTTCACCACGACAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGACCAGTTACCCGTTATCTTCATAACCGCCACAGACTTGCTCTCTCATAGAAACAGCGGAATCAATATGATACTTCTGTCAGGTCATCTTaa > 2:391785/1‑300 (MQ=255) taggtcgcTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTTTC‑AATCAACCCCTTGCCGTCGTAATTTTGATTGTTCTTCTTGACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTGTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACt < 1:313271/296‑1 (MQ=255) cgcTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTC‑AATCAACCCATGTCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTcc < 1:33430/301‑1 (MQ=255) 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aaaaaTACCCTTGTC‑AATCAACCCAGTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAata < 2:89650/209‑1 (MQ=255) aTACCCTTGTC‑AATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAATAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTACCATAGAAACCCCATAAGCCGTCTGATACTTCTGTCCGTTCATCTTAACTCATCCAGGTCCGCGTTTTTGATTACg > 1:380149/1‑301 (MQ=255) cccTTGTC‑AATCCACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTGTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATAAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGATTACGGAt < 1:335152/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |