| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,798,351 | Δ3 bp | 2.8% | coding (143‑145/405 nt) | stpA ← | DNA binding protein, nucleoid‑associated |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2798354 = | 146 (1.200) | 4 (0.030) | 4/478 | NT | 2.8% | coding (142/405 nt) | stpA | DNA binding protein, nucleoid‑associated |
| ? | NC_000913 | = 2798350 | 141 (1.190) | coding (146/405 nt) | stpA | DNA binding protein, nucleoid‑associated | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CCCTAGCAGCGACATCCGGCCTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGTCTTTCTTTAGTGACAACCCTGAATTTTTCGAGCATTTCTTCAAGAACGTCAATGGAGAATTCGCGAGCCATCGCACGGAGGGTGCGAATGTTATTTAAACTTTGTAACATTACGGACATAATAAAGAAAACCTTTTAACGCCAAAACAAAAAAAGTATTTCGTCGCGTAGTGTAAGCGATCACTTATTATATTTCCACAAAATTTAATCTATTTACAGTCCTGCGCGAGATTATTTCAGCTGTTATTTTCTGAAACTCTCAGAATAATTT > NC_000913/2798063‑2798646 | cccTAGCAGCGACATCCGGCCTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTCATCTTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTATCAGCGCGCGGTGCCGCAGCAGAGCTTTTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCTTCTGCTTTCATCAGCCCCAGCCAGGGGCTACTTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACTCTGCGGCTGttt > 1:567683/1‑300 (MQ=255) tAGCAGCGACATCCGGCCTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGttcttc < 2:985715/301‑1 (MQ=255) ccctagcagcgacatccggcctcagtaattagatcaggaaatcgtcgagagatttaccttctgccagcgcctgagcaattggcttcggtgtacggccctgaccggtccaggttttagtttcaccgttaacatcggttaattgatatttcgccggacgcggctggcgttttttaccagcgcgtggtgcagcagcagagctattacccaataactcttccgggttaattccgtcagctttcatcagctccagccaggtgctaattttttcctggcgctctgccagttcacGCtgctgtggttt < 1:1095775‑M1/13‑6 (MQ=255) cGACATCCGGCCTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGttcttcttc < 1:442050/298‑1 (MQ=255) cccGGACTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGGGAGATTTACCTTCTGCCAGGGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGGTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGtc < 1:1117394/300‑1 (MQ=255) gCCTCAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGtcttt > 2:338650/1‑300 (MQ=255) tCAGTAAGTAGATCAGGAAAGCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGAGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAATATCGGTGAATGTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTGCTTCTTCACGTctttcttt < 2:525983/301‑1 (MQ=255) cAGTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTGCCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACgctgctgc < 1:1191143/274‑1 (MQ=255) gTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACgctgctgc < 2:612100/272‑1 (MQ=255) gTAATTAGATCAGGAAATCGTCGAGAGATTTACCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACgctgctgc > 1:612091/1‑272 (MQ=255) 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aCCTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGTCTTTCTTTAGTGACAACCCTGAATTTTTCGAGCATTTCTTCa > 2:1141555/1‑301 (MQ=255) ccTTCTGCCAGCGCCTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATCACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCATCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGTCTTTCTTTAGTGACAACCCTGAATTTTTCGAGCATTTCTTCaa > 1:544926/1‑301 (MQ=255) cccTGAGCAATTGGCTTCGGTGTACGGCCCTGACCGGTCCAGGTTTTAGTTTCACCGTTAACATCGGTGAATTTATATTTCGCCGGACGCGGCTGGCGTTTTTTACCAGCGCGTGGTGCAGCAGCAGAGCTATTACCCAATAACTCTTCCGGGTTAATTCCGTCAGCTTTCATCAGCTCCAGCCAGGTGCTAATTTTTTCCTGGCGCTCTGCCAGTTCACGCTGCTGCTGTTCTTCTTCTTCACGTCTTTCTTTAGTGACAACCCTGAATTTTTCGAGCATTTCTTCAAGAACGTCAATgg < 2:567692/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |