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ccAGATTTACTTCGCAATGTTCCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACAt > 2:453901/1‑279 (MQ=255) ccAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTATACATACGATataataa < 1:1026404/301‑1 (MQ=255) aTTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTATACATACGATataataat < 1:1116851/298‑1 (MQ=255) aTGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatac < 2:716905/271‑1 (MQ=255) aTGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTatac > 1:716882/1‑271 (MQ=255) gTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCAt < 2:1143016/229‑1 (MQ=255) gTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACa > 2:878174/1‑260 (MQ=255) gTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACa < 1:878140/260‑1 (MQ=255) gTACAGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGTGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCGCCAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGCTGGTTGCTTGCGCAt > 1:1142966/1‑229 (MQ=255) 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1:267841/209‑1 (MQ=255) gtgatgCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGc > 1:293361/1‑136 (MQ=255) gtgatgCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGc < 2:293369/136‑1 (MQ=255) | AAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGATGTAATCAAAAATGGTAGTTTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT‑GGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTTTACATGATTATACATACGATATAATAAT > NC_000913/2773949‑2774402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |