| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,304,762 | 0 | T→C | 5.0% | 3.0 ‑0.4 ‑0.0 | 114 | intergenic (+369/+346) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (62/42): total (67/47) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.01e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC > NC_000913/2304463‑2305044 | aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCCTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCTGCCTCTCACGCCCAAACCGGTTGCCTGCTGCGACACTGGCGCGTCTTCTCCGGCCACCACCGCCGTTGATTGCCCCACAC‑CGTCGGTTg > 1:250478/1‑301 (MQ=11) 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ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGT‑GGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCCCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTGGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGCCCTCTACAGCCCAAGCCGGTTCCCTGCTGCCAAGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCT‑CACACGCAGTGTAGTGACCCACCCCGGGGGTGTGCACAGGCGGTAAcgcccccaccatcctctcagacccg > 1:596270/1‑280 (MQ=11) gcgcgcgaccgcttgggatggttCCACCC‑CGTAGGTGGGAAGAGTCGGTTACGCCGCATACGAAATCCAACGACCTGGCCGGTAGCCTGAGTCGACGCTGGGGCGTCTTAGCAGGCCGACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGGAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCGACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGcc < 1:907459/278‑1 (MQ=11) acacCGCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGA‑CGTGCTCCACCCCGTAGGTCGTATCAGGCGGTTCCGCCGCATCCGACATCTAACGCCCCCGCCGTTGGCCTGATCCGACGCTGCCGCGTCTTATCAGCCCTCCAC‑GGCTTTGCGCTGCTCCACCCCCTAGCTTGGATGAGGCGGTTCCTCCGCATcctccgcctcacgccacgac > 1:549524/1‑282 (MQ=11) ccGCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑CGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCCCATCCACCATCTCCACCCCGAGCCggg > 1:907408/1‑300 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATCCGACGCTGGCGCGCCTTATCATGCATACAC‑CGCTCTGCGGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGATCAGCAGGTTACGCCGCATCCAACCTCTACCGCCCGAGCCGGTTg > 1:1039922/1‑301 (MQ=14) gtgAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTCGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGTTTGcc > 2:535173/1‑300 (MQ=255) gtgAAATGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaccc > 2:475844/1‑220 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCTACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCC‑CGCTCTGACGTCCCCCCCCCCGCAGGTCGGGTCAGCCGCTTACGCCGCCTCCCACactccacgccccaccccgtttccta > 1:154442/1‑276 (MQ=11) gCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACg > 2:316954/1‑278 (MQ=39) | AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCC‑CGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGA‑AGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC‑CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGC > NC_000913/2304463‑2305044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |