| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 521,734 | Δ90 bp | 4.8% | coding (1319‑1408/2415 nt) | ybbP → | putative ABC transporter permease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 521733 | 103 (0.950) | 5 (0.050) | 5/532 | NT | 4.8% | coding (1318/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | 521824 = | 98 (0.920) | coding (1409/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCTTGGCACCATGACGGTCATCTCGCTGCTGGTGGGGCTACGACCATATCGCTTGTTGCTGGCAACGCAGCCTTTACGCGTATTACGTAATGATGTGGTAGCGAACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGAAG > NC_000913/521435‑522033 | ccTTGGCACCATGACGGTCATCTCGCTGCTGGTGGGGCTACGACCATATCGCTTGTTGCTGGCAACGCAGCCTTTACGCGTATTACGTAATGATGTGGTAGCGAACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTgcgc < 2:948572/300‑1 (MQ=255) 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ttGACGTTGAATTCGGTGACGCGGCTGCGGGGGGTTGGCGGCTTGTTCCGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCTGAATGTTCGTGACCATTGAGGCTGCTGGAACTGCTGCTGGTGTGGCGTGGCGAGCGGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGCAGAACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAAc < 2:14601/299‑1 (MQ=255) tGCGGCTGGCGGGTAGCCGCCTGTTCCGTCAGCCGTGGTACACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTTGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGa < 2:649727/301‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGa < 2:56094/301‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGa < 2:59882/300‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGAAg < 1:34045/301‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGGCAGCTTTCGGCTTTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGAAg < 2:570774/301‑1 (MQ=255) | GCTTGGCACCATGACGGTCATCTCGCTGCTGGTGGGGCTACGACCATATCGCTTGTTGCTGGCAACGCAGCCTTTACGCGTATTACGTAATGATGTGGTAGCGAACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATCCGGTGGTGCGGGCGCGGCTGACGGCGATTAACGATAAGCCGACAGAAGGTAATGAAG > NC_000913/521435‑522033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |