New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1007710 = | 52 (0.890) | 3 (0.050) | 3/586 | 8.7 | 6.0% | intergenic (‑110/‑134) | ycbX/rlmL | 6‑N‑hydroxylaminopurine detoxification oxidoreductase/23S rRNA m(2)G2445 and m(7)G2069 methyltransferases, SAM‑dependent |
? | NC_000913 | 1007795 = | 43 (0.750) | intergenic (‑195/‑49) | ycbX/rlmL | 6‑N‑hydroxylaminopurine detoxification oxidoreductase/23S rRNA m(2)G2445 and m(7)G2069 methyltransferases, SAM‑dependent | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
ATGCACAGGTGAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGTTTACCAGAG > NC_000913/1007412‑1007983 | atGCACAGGTGAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTc < 2:87764/301‑1 (MQ=255) atGCACAGGTAAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACGGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTc < 1:51584/301‑1 (MQ=255) tGCACAGGTGAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCa > 2:517790/1‑301 (MQ=255) gTGAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGtt < 2:493979/297‑1 (MQ=255) gAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGcc > 2:524249/1‑300 (MQ=255) taaccagTACCATCGTGGGAACCTGTGGAGAGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTa < 2:485046/295‑1 (MQ=255) tAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGt < 1:428571/299‑1 (MQ=255) tGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCt > 2:234151/1‑300 (MQ=255) gggAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCa > 2:221312/1‑300 (MQ=255) gAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATCTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACTGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTCTGACATGACGCGCGTATTTGCTATAACGCGCAACCATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTTTGCTCGCTATCCTCACGt > 1:445332/1‑301 (MQ=255) 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ttCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCtgtcca < 2:56681/301‑1 (MQ=255) ttCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCtgtcc < 2:334336/300‑1 (MQ=255) aGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAgactga > 2:96588/1‑299 (MQ=255) 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ggCATATGTAAGACCAATACCGCGCATCGAGTGAACAGTATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGATCCTCAAAGGAAAATAAGCCCTCATCGTTATGACAGGACGCGCTTATTAGCTATAATTCGCAACAATTTTCGTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACGGCGGTAGGCTCTTagag < 1:69955/298‑1 (MQ=38) ttcagacgtgtgctcttccgatctggATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGata < 2:318553/276‑1 (MQ=255) aCAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTa > 2:341037/1‑300 (MQ=255) 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tattaGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCAtt > 2:385684/1‑301 (MQ=255) taGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTGGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGATCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCa < 1:523585/301‑1 (MQ=255) aGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGGCCATTTCaa > 2:276670/1‑301 (MQ=255) aTGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGa > 2:568232/1‑300 (MQ=255) ttttCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGt > 2:394386/1‑301 (MQ=255) ttCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGttt < 2:201763/301‑1 (MQ=255) tttAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGGCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGTTTAc < 1:393918/300‑1 (MQ=255) ttAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGTTTAcc < 1:385238/301‑1 (MQ=255) gcCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGTTTACCagag > 2:42155/1‑300 (MQ=255) | ATGCACAGGTGAAGGAGTAAACCGTACCATCTGGGGAAACTGGCGAGCGGTAATAAACGTACCGTCAGGTTCCGTGATCATAAAGATGCGATCGAAGGCCAGACCACTGACATCTGCCAGAGCATGTGTAAGACCAATGCCGCGCATCGATTTAACAGGATGAATAAAAAGCCGGATTAATGTCGCCACGGTGCGGTCCTCAAATGAAAATAAGCCCTCAACTTTATGACATGACGCGCTTATTAGCTATAATGCGCAACAATTTTCTTAGCGCCTGTCCCATTAGGCTATTTTATTTGTCAGTTTGGCCCTGGGTTATGCTCGAAATCCTCACGTACTTGTGTACGCTCCGGTTTCTCCGCGCTGTCCATGTCCAGACTGACTGCAACAATTACGCCTACTGCGGTAGGCTCTTAGAGTAAAAGTGACGATATGAATTCTCTGTTTGCCAGTACGGCCCGTGGGCTGGAAGAGCTGTTAAAAACTGAACTGGAAAACCTGGGGGCCGTTGAATGCCAGGTGGTTCAGGGTGGGGTCCATTTCAAGGGCGACACACGGCTTGTTTACCAGAG > NC_000913/1007412‑1007983 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |