| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | 7 (0.050) | 7/530 | NT | 4.4% | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1393461 | 153 (1.020) | coding (235/1614 nt) | mppA | murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
AAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCTGCATCAGTTTGGAT‑CTCACTTGCCTTAAATGCGCTCTCTTTGGCGGAAAATGCCAGTGTCA > NC_000913/609052‑609649 | aaGGAAACTGAACGCGCGAAAGCTGGGATATTGACTAATCTCCGCGCCGCAGTTTTAAGTGACGACATAATCCCGCCAGCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGGGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGTTCATCTGGAGCTTACAGGGGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAg < 2:799568/301‑1 (MQ=11) 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ttGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCACTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 2:707772/1‑301 (MQ=255) gCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGAATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTATTCAGATGGTTCAACACTTCAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCACAGCATATCCGGTTGTCCGTTCAGTAt > 2:760597/1‑301 (MQ=255) aaTCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATACTCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAACGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATACCAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGAAAGCCTACACAACGCAATTGAAGACCGCGAGTCATCTTCTTACCGATGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAACTGGTGCAACCCTTAAGTGAGCGCTTATGGCAGTAATCCCAGCATATCCGGTTgtcagggccggtttga > 1:1270363/1‑291 (MQ=11) 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tggtgAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGGAAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTCCACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCTGCATCAGTTTGGAT‑CTCACTTGCCTTAAATGCGCTCTCTTTGGCGGAAAATGCCAgtg < 1:579140/297‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCAGATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTGAGCCCGTGGTCAGTGACGGCTGCGGGCGAATCTTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTAGCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCGCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCTGCATCAGTTTGGAT‑CTCACTTGCCTTAAATGCGCTCTCTTTGGCGGAAAATGCCAgtg < 2:1496031/301‑1 (MQ=255) ggAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCTGCATCAGTTTGGAT‑CTCACTTGCCTTAAATGCGCTCTCTTTGGCGGAAAATGCCAGTGTc < 2:780413/300‑1 (MQ=255) | AAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCTGCATCAGTTTGGAT‑CTCACTTGCCTTAAATGCGCTCTCTTTGGCGGAAAATGCCAGTGTCA > NC_000913/609052‑609649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |