| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 101,138 | 0 | C→T | 6.7% | 13.7 ‑1.0 ‑0.0 | 160 | A125V (GCC→GTC) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (7/4): ref base (69/75): total (78/82) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.62e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.00e-01 | ||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCA‑CGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCATGAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTG‑CCGAAATGCTGGC‑TGAGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACCACC‑GCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCAT‑CTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTAC > NC_000913/100838‑101436 | tCGGGATTGGTGGGGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCA‑CGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCATGAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTG‑CCGAAATGCTGGC‑TGAGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGc < 2:259700/301‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACCACC‑GCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCCTGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGGGTTATGCATTGTTCCCGCAT‑CTGCAACCCATGGTGGCGATTGTCCCCAATCTCGAAGCCGACCACATGGACACCCACCAGGGCGACCTTGAGAATTTAAAACAGACttt > 1:1533304/1‑301 (MQ=255) gTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACCACC‑GCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGAt < 1:894074/174‑1 (MQ=255) tGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACCACC‑GCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCAT‑CTGCAACCGCTGGTGGCGATTGTCACCACTATCGAAGACGCACACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTaa > 2:1567637/1‑301 (MQ=255) cggcATGGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACTACC‑GGTATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCGCGACCCAA‑CCTTCGTGAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGGTCAGGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCAT‑CTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCg < 2:1533364/298‑1 (MQ=255) cGCCATGGGCGG‑AACGCACGGGCAAACGCCAACCACC‑GGGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GGGGGGCTCGACCAGA‑CGTTGGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTGCAGGCGCGTGTGGGGCATGGGCGGTACCTGATGGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGGTCCTGCAT‑CTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGcc < 1:599400/300‑1 (MQ=255) tGCCGG‑AACGCACGGGAAAACGTCAAACACC‑TCGATGGTTTCCAGAAGCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGGTAACGGCGGGCTGTTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGGTTGGGGCATGGGCGGGACCTGAGTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCAT‑CTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTGCTGCACAACCTGCCGTTTTAc < 2:868566/301‑1 (MQ=255) | TCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCA‑CGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCATGAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTG‑CCGAAATGCTGGC‑TGAGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGG‑AACGCACGGCAAAACGACAACCACC‑GCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAA‑GCGGGGCTCGACCCAA‑CCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCAT‑CTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTAC > NC_000913/100838‑101436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |