| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 286650 | 113 (0.740) | 6 (0.040) | 6/510 | NT | 5.2% | coding (1256/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| ? | NC_000913 | = 286682 | 109 (0.740) | coding (1288/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAA > NC_000913/286383‑286979 | tCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGTCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGCGGCGCTCACCACCATCAAAAATCT‑GTTCTGCGTGGTGCCCGTGGTGCTCTCCGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCCCTCTCCCAGCTCACCg > 1:287887/1‑300 (MQ=255) tcgacccccgcgCCGCTGCAGCGGCGGATGGGTTATGACGTGCTGGCGTGTGAGGATGGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGCCGGGC‑TGGTGTGCTTCACCGACCTGTTCGGCCTGATGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGTCGGTGGTGGGCTGGTTCCTGGCGTA‑CGCCAACTAGTCCTCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGTGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCTGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCGACAAGCTAACCGatgccc > 1:1196055‑M2/4‑295 (MQ=255) ctcgccgcGGCAGTGGCTGATGGCTTCGGACGTTGTGGACTATGAGGAGGGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTGTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAg < 2:800151/299‑1 (MQ=255) cacGGCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGGTGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAg < 2:1026694/301‑1 (MQ=255) cTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCAGTCGCCGCCTCGACGGGA‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCATGAAGATTGGACTGACGATTGGCGGGAAGGTGATGGGCTGGATCATGGCGTA‑GGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGAAGCCGGTTGAAGTGCTAACCACAAACAAGATGCT‑GTTCTGCGTGGTGACGGTGGTGCCGAACGGGGGACTGGGCGACATGATGTGCAGCGAAAAGATCACCGAGGCGCGCGTGGAGACCCTCa > 2:1030727/1‑301 (MQ=255) cTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGCGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTTCCGGTGTTGCCCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCCCTCCACACACTCTCCTATGCCCGCATGGAGGCCCTCCGCCACCAGCTCATTaa > 1:1317591/1‑301 (MQ=255) cTGTCGTGGGGGACGACGAGGGGGGCCGCAGGGGTGGCCGCCTGGACGGGC‑GTGTGTTCGCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGc < 1:1382268/300‑1 (MQ=255) tGAAGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCAGCTACCTGGTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTAGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAc < 2:287893/301‑1 (MQ=255) gacgtgtgtgtgtACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCAGCTGCGACGGTC‑TGGTGGTCTCAACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGAGTGGCGTGGCGGTGGTGGGCTGGAGCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTTAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑TTTCTTCGTGGTGCCGTTGGTTCTCTTCTCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATTCCCTCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAc < 2:117586/288‑1 (MQ=255) gACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTAACTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAACATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTTCTCTACGCGGGCCTGTTCATCATGCTGTAGCTCTACAAGCTCCCCCCTGCCCCCGTGGCGGTCATCCGCCGGCCGCTGAttccgccc > 1:579237/1‑294 (MQ=255) 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cccACCGATGCCCGCGGGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGAc < 2:80371/297‑1 (MQ=255) cACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGACTCTACCACTCCCGTGCCCTGAAAACCTGGTCGCTGGTCAGCCCCCCGTTGGACCGCGTGTCGCGCCTGGCCATg > 2:124497/1‑300 (MQ=255) aCCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCCCCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCAACTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTTCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAACCCCGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACAGCGTGTCGATGCTTGACATGaa > 2:1031742/1‑301 (MQ=255) | TCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCT‑GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAA > NC_000913/286383‑286979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |