| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4187665 | 185 (1.210) | 3 (0.020) | 3/528 | NT | 1.6% | coding (2316/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4187669 = | 184 (1.210) | coding (2320/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTG > NC_000913/4187373‑4187965 | cGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAtctc < 2:970196/301‑1 (MQ=255) aaaCGCTACAACAAAGTGATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGGAGCCAAAGCGAGGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCGACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTccaccc < 2:164717/300‑1 (MQ=255) cccggacagctccatcagagacacgcgttGCGGCGCACGATCGTTTATCCACAGCTAGCCTGTACAATCTGCTAACCGCAACCGTGATTAACCTGGTCGGGAAGCAAGAGAAGCAGGTTGCCGTCCACTGCATCGACCTGATGGCCGACTCCTGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCGATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACgg < 2:753221/273‑1 (MQ=255) tACAACAAATTGATCGATATTTGGGCTGAGGAGAACGAACGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGGGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTccacccac < 2:832170/297‑1 (MQ=255) aaacaacGGTATCGATAGCTGGGCTGCGGCGAACGAGCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCt < 2:569088/300‑1 (MQ=255) aaaGTTATCGAGGTCTGTGCTGCGGTGAACGATGGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCCGCAAACTGAACCCGGGATTAACCGTGGCGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACCGCATCTACAGGAGGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGGCAGCTTGCTGGTAGGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTa < 1:490585/301‑1 (MQ=255) atagCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGc < 2:261813/301‑1 (MQ=255) tatCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCCCCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCg > 2:876637/1‑301 (MQ=255) gggCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGGGTGGTCTGATGGCGAAACCGGGTGGCCCCATCATCGAAACGCGGCTAGCCGCGAAGTTCCGTGACGGGCTGAACGTACTACAGTACTCCAGCTccacacaccgcggtcctgtatacacatcggaccg > 1:753212/1‑275 (MQ=255) gggcgaggcgagagacgtgtggtCCAAAGCGATGATGGATAAACGGCAAACTGAAACCGGGATTAACCGTGACAGGAAGGAAGAGAAGCAGGTTGCCGTCCAAAGCATCGACATGATGGCCGACTGCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCGGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATAc < 1:1000463/278‑1 (MQ=255) cTGGGGTGAACGATCGGGGATCCAAAGCGATGATGGAGAACCCGCAAACTGAAACCGGGATTAAACGGTAAGGGCAGGAAGGGAAGCAGGTGTCCTGCCACGGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTGGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCAAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGc < 1:895228/301‑1 (MQ=255) aaCGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAAGTTGCAAACTGAAACCGGGATTAACCGGTATGGGCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCAGCTACATGAGGGCCGACTTCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAGCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGaaa < 2:961494/300‑1 (MQ=255) aaCGAGCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAATCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGaaa < 2:1003732/300‑1 (MQ=255) aTCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTACCCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAgg < 2:84911/274‑1 (MQ=255) aTCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGACAATCACAGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTGCTCCAGTACTTCATCTCCAACCACGGTGCTCGTAAAGGACTGGCGGCTACCGCACTGCAAACTg > 2:486944/1‑300 (MQ=255) cGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGCTGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTCCTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAACGGTCTGGCGTCTACCGCCACGAAAACttcaa > 1:1175757/1‑297 (MQ=255) cGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATAATGGCCGCCTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACACACGCTCGTCGTAAAGGACTGGCGGATACCGCACTGAAAACtcaga > 2:1323564/1‑297 (MQ=255) gtgtATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTCGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGACACGCCAATCACCGCGACCTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTCCTTCATCTCCACCCACGGTTCCCGTGACGGTCTGGCTGATACCGCACTGAAAACTGCgc > 1:565469/1‑299 (MQ=255) gCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTAc > 2:917691/1‑300 (MQ=255) 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ccAGTACTTCATCTCCACCCACGGGGGTGGGAAAGGTCTGGCGGATAACGCACGGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGAc < 1:1042302/301‑1 (MQ=255) aCTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGTGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGAATCCGGTTATCGCGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGCAGCCGGGTACTGCTGATATCATAGTTCCGCGCAGACCGCTGCTTCACGAACCGGGGGTTGACcta > 1:685002/1‑298 (MQ=255) cTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCTAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGGGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTAATGCTGATATCCTCGTTCCGACCAACCGCCTGCTGCACGacctgggtgggaacctgtgg > 2:604570/1‑282 (MQ=255) | CGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTG > NC_000913/4187373‑4187965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |