| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 101,138 | C→T | 7.9% | A125V (GCC→GTC) | murC → | UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 101,138 | 0 | C | T | 7.9% | 423.9 / 18.9 | 156 | A125V (GCC→GTC) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (65/76); new base T (6/7); total (72/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCACGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCAT‑GAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTGCCGAAATGCTGGCTGAGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGGAACGCACGGCAAAACGACAACCACCGCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAAGCGGGGCTCGACCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTACGG > NC_000913/100841‑101438 | gCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGACGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAAACCGGTCACGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTATATTCAACAATCGACCGGAAAACGTACGTGAGCGCAGCCTGGTCGTTGTTTCAAGCGCGATTTCGGCCGCTAACCCGGAAATTGTCGCGGCTCAT‑GATGCGCGTATTCCGGTTACACGCAGTGCAGCAGTGACGCATGCGTTAATGCGTTGTATTCTTGGCATCGCCCTTGCAgg > 1:1114492/1‑301 (MQ=255) 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ccATTGCCGGAACGCACGGCAAAACGACAACCACCGCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAAGCGGGGCTCGACCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGCTGGACGTGATGCATTGTTCGTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGGCCACAGGGATCCCTCCCAAGGCGTCTTTGAGAATTTAAAACAGCCTTTTAGTAATTTTCTGCCCAACCTTCCGtt > 2:509022/1‑301 (MQ=255) | GCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCACGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCAT‑GAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTGCCGAAATGCTGGCTGAGTTAATGCGTTTTCGTCATGGCATCGCCATTGCCGGAACGCACGGCAAAACGACAACCACCGCGATGGTTTCCAGCATCTACGCAGAAGCGGGGCTCGACCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTACGG > NC_000913/100841‑101438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |