Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 323,369 | G→A | 86.3% | V344V (GTG→GTA) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 323,369 | 0 | G | A | 86.3% | 366.8 / 37.8 | 148 | V344V (GTG→GTA) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (13/7); new base A (70/53); total (87/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTG‑ATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAACACCACTCAAATTTGGCG > NC_000913/323074‑323661 | cgaCGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGAGACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTtc < 2:177126/299‑1 (MQ=255) ggTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGAC‑GGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCCATTGGTGCGGTCATTTCTCCGCTACTTggcg > 2:1072082/1‑301 (MQ=255) gTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGATGGGCACGTTGGTGGTCCTGAAGAGGTTCAGCTGGTTATTATCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAACTTCGGTATGTTCTGCGCTGTATTAGCTGCGGGGCTTGTTTGCATAGTTGTCCGCAATTTCGCCTTGTTTGCGGTCCGGGGTATGGCTCTGTTTGTCCAGCGCAAGTTGGTGTTGTCATTTGTCCGCTCCtttggg > 1:1378153/1‑297 (MQ=255) gTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGATGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATGCTTGTACGGCATATCGCCATGTTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCCAATGGTGCGGTAATTTCTCGGCTACTTGGCGGAtata > 1:781312/1‑301 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |