| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 156 (0.940) | 40 (0.330) | 10/438 | 14.8 | 27.2% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097503 | 100 (0.820) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAG > NC_000913/1096664‑1097248 | ggTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATCTGCACGATTTCACCTCGCCCTAACAGACGTAGGCGGGGGCAccc > 1:1524454/1‑300 (MQ=255) aTTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCTCCTCGCCCTAACAGACGTGGACGGGGGCACCCGgtg > 2:426216/1‑301 (MQ=255) gCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATCACGATCTTATGCTGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGATGTGATAGGAAGTGACTAGCTAGTGAATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAATCAGACAGTTGTTGTGAACGATTTCTCCTCGCCCTAACAGCCGTGTGGGGGGGCACCCGgtgt > 1:223532/1‑298 (MQ=255) cagcGCTTGTAGAATTTCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTTATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGtgtgtg < 2:223780/297‑1 (MQ=255) cAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGtgtgtg < 2:361333/300‑1 (MQ=255) cAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGCGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGc < 2:599711/301‑1 (MQ=255) aaTGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTGTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCGGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTCGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGaa < 1:1045745/299‑1 (MQ=255) taTTTGTTTTGAAGCCTATTTTTTACTTTGCTATGTACCGGGCTTAATTTATTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGAGTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGcc < 1:351195/300‑1 (MQ=255) tttttGTTTGTAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGaaaaaaaaagcc < 1:405727/300‑5 (MQ=255) acgctcttccgattcTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCGGGCATAACGATTTTATGATGGCATTTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGcc < 1:1046834/286‑1 (MQ=255) aTTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGcc < 2:307266/300‑1 (MQ=255) tttGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGCGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGccc > 1:552588/1‑300 (MQ=255) ttgTTTTAAGCCTATTTTTTACTCTGTTATGTACCGTTCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCTATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTa < 2:1192336/299‑1 (MQ=255) 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aaGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCg < 2:1167429/300‑1 (MQ=255) tcgctattattgccacgtcTATGTGACCTGCCTAATGTACTATTTTTTCTATTGTCGATGCCTCTGGCATAACGAGTTTATGAGTGCATGTGACAGTTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGGGCTAGGAAGTTACCAGATAATAAATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTa < 1:1473301/283‑1 (MQ=255) cTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTCCTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCATACAGTTGATGTTCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGCTCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTAAGa > 2:1475152/1‑301 (MQ=255) 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cAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCCACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTTTTCGCACTTCACGAACG‑AAAAGCCCGTCCTTTCCTACCAGCTCGTCTTTAAATTTGGTGCGTG‑GGGGGGGGTTGGCTCGCCTCGCTCTCCCttc > 1:1321479/1‑298 (MQ=14) aGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGCAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATAGACTATCAGCGCCCGCACCGCCAGCAGCCCACTCCTCGCGTTCTCAGTCTGTC‑CTACTGGCTATCGCCAGTTGTCGTCCCCCGGGCGCG‑GCTTCTCATCCCCCCGGCTTGCGCCTTACCAGAAAT‑AAAAGCCCGTCCTCTCGTTAGCACTCTCAATTAAATACGGCG‑GTGTgggggggtgatcggaacctcactgtcaataga > 1:889006/1‑275 (MQ=2) aGACGGGGTGGGGGGCACACGGTGTATGCAATATAAGAAAAAAAGGCGCGTACTTTCGTAAGAGCTATTCTTTAACTAGGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGCCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTGGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCg < 1:1283275/300‑1 (MQ=11) gACGGGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTTCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCgg < 2:1161599/300‑1 (MQ=38) gTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCAATGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCggtgag > 2:133528/1‑297 (MQ=38) tGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGGGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAg < 2:143259/300‑1 (MQ=38) | GGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTC‑CAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGG‑GCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAA‑AAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCG‑GTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAG > NC_000913/1096664‑1097248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |