New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 1279464 = | 154 (0.940) | intergenic (+116/‑400) | narK/narG | nitrate/nitrite transporter/nitrate reductase 1, alpha subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CGGCGGCGGCGCTGGGTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATC > NC_000913/1279164‑1279764 | cggcggcggCGCTGGGTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAAt < 2:1404378/301‑1 (MQ=255) cggcggcggCGCTGGGTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAAt < 2:1062142/301‑1 (MQ=255) gcgtttggTTGCATCGCGGGGATTGGCGCTATTGGTGGCTTCTTTATGCCGGAAGCGTATGGTAGCTCGCTTGCATTAACGGGTTCGCCAGACGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTACTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATag < 1:389849/294‑1 (MQ=255) gTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAat > 2:1138836/1‑301 (MQ=255) ttcagccgtgtgctcttccgatttggCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTg < 2:210099/278‑1 (MQ=255) tGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTAt < 2:459451/301‑1 (MQ=255) cgATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGACTTATTTAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCCCgg > 1:211528/1‑301 (MQ=255) ctttgttATCCCGTAAGCGTTTGGTACCTCGCTGGCATTACCGGGTTCGCCATTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTTTATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTc < 2:1027527/295‑1 (MQ=255) cttcttTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAAAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGACattatgca > 1:1267026/1‑298 (MQ=255) ttATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCtt > 2:1111015/1‑301 (MQ=255) 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aaaGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATg < 2:130852/301‑1 (MQ=255) aaGCGTTTGGTAGCTAGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGc < 1:1360411/301‑1 (MQ=255) acgtgtgctcttccgatcccGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCAttt < 2:1090361/281‑1 (MQ=255) 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tGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCAt > 1:1336794/1‑301 (MQ=255) tGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCAt > 1:653170/1‑301 (MQ=255) tAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATc < 2:653862/300‑1 (MQ=255) 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CGGCGGCGGCGCTGGGTTTCATCTCTGCGATTGGCGCGATTGGTGGCTTCTTTATCCCGAAAGCGTTTGGTAGCTCGCTGGCATTAACGGGTTCGCCAGTCGGCGCAATGAAGGTATTTTTGATTTTCTATATCGCCTGCGTAGTGATTACCTGGGCGGTATATGGTCGGCATTCTAAAAAATAAACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCACTTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATAGAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTTAGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATATGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATAACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATC > NC_000913/1279164‑1279764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |