| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 88,334 | C→T | P103S (CCA→TCA) | cra → | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 88,334 | 0 | C | T | 99.4% | 547.3 / NA | 159 | P103S (CCA→TCA) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (87/70); minor base A (0/1); total (87/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TGAAATCGCTCGGCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAG > NC_000913/88039‑88625 | tGAATTCGCTCGGCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGAc < 1:1388669/301‑1 (MQ=255) acGCTCGGCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTTAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGa < 2:165610/300‑1 (MQ=255) cacGGCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAGAAGTCATGGCTTGGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAAt < 1:1299464/299‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCg < 2:1157319/300‑1 (MQ=255) ggCGTGGGTGTCACGGACCAGTGGAAGCTATGTGAGTAAGGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGATAGAAAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTGCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTg < 1:1283316/300‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGTCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGCACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTACCTTTAACGCCCAGCGCGGCAACTGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGACCAGAAGATCAGTCACACAACGAAATGCGGTTCAttacg > 1:1477897/1‑297 (MQ=255) gtgtCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAg < 2:1353117/300‑1 (MQ=255) gaccactgatgtcgatcttgattacagCAAATTGAAGCAATTCCGTGTAAGCGAAAAGACAGTGGAAAAAGTCAAGGCAGGTGGACGTGAAAACAATTACCTCCCGAACGCTGTGGCAGCTGGGCGTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACGACAGCAATACCCGCATCGCTAACTATCTTGATCGCCAGGAGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGTTGCATTGAGCACCtttt < 1:1273558/274‑1 (MQ=255) gACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACACGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGCCGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTGTCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCTACTGCTGCTTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGCGCACCTTTTa > 1:149609/1‑301 (MQ=255) ctcttccgatcttATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGAACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAc < 1:157210/289‑1 (MQ=255) ccACAGCAGGCTATGTTATTAACGGGAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGGGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACa < 1:1209607/301‑1 (MQ=255) cTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCg < 2:856135/301‑1 (MQ=255) gCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGCCCACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTCCAGCGt > 1:586610/1‑300 (MQ=255) gCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGt > 2:703988/1‑300 (MQ=255) aaGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAg > 2:1411308/1‑301 (MQ=255) ttatcaACGGAAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGAAAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGc < 2:379572/301‑1 (MQ=255) ttaACGGCAAAGCGAAGCAATACCGGGTGACGGACAAAACCTTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTTATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCat < 2:1309141/301‑1 (MQ=255) aaCGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCattt > 2:613219/1‑300 (MQ=255) aaaGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTCTCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTAACAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTCCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGTTTGATGCCTTTATTGttt > 1:445894/1‑301 (MQ=255) aaaGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGttt > 2:1019219/1‑301 (MQ=255) ctctgccctacacgacgctcttccgatctccGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCGGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCg < 1:1276508/272‑1 (MQ=255) gAAGCAATACGGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAGAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATGCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGAc < 1:1405708/300‑1 (MQ=255) gCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGAcgtcg > 2:959963/1‑301 (MQ=255) tgtgAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGcctc > 2:1257129/1‑299 (MQ=255) aaCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCtttt < 2:1311914/301‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCCGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCCCCTGAGCATCCttttt > 1:1446281/1‑301 (MQ=255) ccGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCGGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGagatcggaagagcacacgtctgaactcca > 2:1278081/1‑273 (MQ=255) aaaaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGCCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCACCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCCACGGGGCTCTCAACTGCTGCTTGCTTGCCCAGAAGATCACTCAGAAAACGAAATGCGGTGCATTGAGCCCCTTTTCCAGCGTCAGGTTGCTGCCATCATTGGTTCGCCGTCGTTCCCTCTTGCACCTCCTTCTTTTctcca > 1:193933/1‑296 (MQ=255) tggagttcagacgtgtgctcttccgatctcaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCGTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGc < 2:412751/272‑1 (MQ=255) tCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTgg < 2:587249/299‑1 (MQ=255) tCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACAACAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGc < 2:1479748/301‑1 (MQ=255) tCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCCTCCAGCTGGACGCACACGGCCTATTGGTCTTGTTACCCCCGCTCCGGATAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAAAGCCAGTCGCGGCAACGGGGTTATCAACGTCTGAATGCCTGCCCAGACGATCAGTCAGACAAAGAAACGCGGAGCATTGAGCACCTTTTACAGCCTCAGGTTAATGCACTTATTGCTTCCATGTCTTTGCCACCTGAGCAACCATTTTATCGACGCTggg > 1:221469/1‑300 (MQ=255) tgtgGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGa > 2:1117539/1‑300 (MQ=255) gtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGt > 2:1221220/1‑301 (MQ=255) cGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTc > 2:729228/1‑300 (MQ=255) tGAGCCCAATTCCCCCCCGATCGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTccc < 1:704208/300‑1 (MQ=255) aGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGa < 1:612580/300‑1 (MQ=255) cacaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTg > 2:338739/1‑301 (MQ=255) gTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCT‑‑TGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGCCCGCGCCCTCg > 1:1258477/1‑299 (MQ=255) cTGGGCTTCGTGCTTGACGCACACGTTCTAATGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:1013051/300‑1 (MQ=255) ggagttcagacgtgtgctcttccgatCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGa < 2:416782/275‑1 (MQ=255) cTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAg < 2:1037306/301‑1 (MQ=255) tGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTccacac > 1:47681/1‑295 (MQ=255) acgtgtgctcttccgatCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGt < 2:1451507/282‑1 (MQ=255) ccgtgcgaTTGATCTGGTGATCACCTATCTGGAGAGCAGCAGCGATAACTGCATCGCTACCTATCTTGAACGCCAGGCGCGGAAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggttggt < 1:911741/294‑1 (MQ=255) tATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGAt > 2:1234813/1‑301 (MQ=255) cctacacgacgctcttccGATCT‑GAGAACCCCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCa < 1:1411214/285‑1 (MQ=255) aTTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGaagatcggaagagcgtcgtgtagggcagaa > 1:416294/1‑273 (MQ=255) ttccggtctaTCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAgg < 1:1327516/292‑1 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga > 2:897865/1‑301 (MQ=255) tgtgATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGCCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCTATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACTCTTCACCCGCGTGGTTGCTTCCGCTCCGgctgtt > 1:820805/1‑299 (MQ=255) tgtgATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGcctagagcggacgagcgtcgtgtag > 1:1449707/1‑277 (MQ=255) ttcactgcacgccgcgcttccgatctaCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCGGGCGCGGCAACGGGGGTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTGTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGa < 1:867383/276‑1 (MQ=255) ccccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTTCCGATCCGGATGATCCCCaa > 1:57385/1‑301 (MQ=255) ccccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGAATCGCTAACTATCATGAAAGCCAGGAGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCg < 1:1222426/299‑1 (MQ=255) cGAGCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATg < 1:338350/301‑1 (MQ=255) ggggaACCCCGGCTAT‑CCCGCATCGCGAACGATCTTGACACCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCCACTGCTTACTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGGAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCCGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCg < 1:1018081/297‑1 (MQ=255) ggAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGCTGATGCCGAAATGCTggag > 2:1517141/1‑299 (MQ=255) ggAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCg > 2:736263/1‑301 (MQ=255) aaaCACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGaa < 1:399107/300‑1 (MQ=255) cacCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAagag < 2:194139/301‑1 (MQ=255) ccAGCTATACCCGTATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGtt > 2:550320/1‑301 (MQ=255) ccgataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACg < 1:1255622/298‑1 (MQ=255) cTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACg < 2:1417742/300‑1 (MQ=255) tataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCTCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTACCTGCTCAGAAGATCAGTCCGACAACGAAATGCGGTGCATTAAGCACCTTTTCCAGCGTCAGTTTCATGCCATTATTTTTTCGACGTCGTTGCCTCCTACGCATCCTTTTCATCAACGCTGGGCTAACGGCACGTTCCAGATTGTCTCGCTGGACCTCGCCCTCGCTCGTCAACACTTCACCAGCGTGGTTTGTGCCGTTCAGGCTGAGGCCGAAATGCTTGCGGTGCAGTTActca > 1:1121960/1‑298 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGt > 2:216931/1‑301 (MQ=255) cGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTTACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTCCGTAAGttt > 1:219653/1‑300 (MQ=255) cGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGttt > 2:333445/1‑300 (MQ=255) aTCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCccg < 2:1543341/301‑1 (MQ=255) ttGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGGAAGTTTCCCGCCGAGACGGTg > 2:661529/1‑299 (MQ=255) cGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTAt > 1:386597/1‑300 (MQ=255) gCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGCTCCGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTCAGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGGGCTTTag > 1:36254/1‑298 (MQ=255) atctggCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCt < 2:286764/297‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGGCAACGAGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGCGCTTTATCt < 2:446384/300‑1 (MQ=255) ggCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGt > 2:1131792/1‑301 (MQ=255) gcgcGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACCAAATGCGGTGCGTTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCGACGCTGAGCTAACGACCCGTTCCCGTTTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCGGTGTGGTTGGTGCCTATCTGGATGATGCCGAAATGCTGTCGGAAGAGTTTCGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTg < 2:221717/298‑1 (MQ=255) cgcgGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTgc < 2:883864/301‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCtt > 1:1121619/1‑300 (MQ=255) cAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCAGCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGGTAACACTTCACCATCGGGGTTGGTGCCGAACCGGATGATGCCGAAAGTCAGGCTGAAGAGCTAAGTACTTTTTccgcgagaactgtcacttatctgtgtgtgata > 1:743119/1‑272 (MQ=255) ggTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAg < 2:57440/300‑1 (MQ=255) ttATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCCCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTCCGTAAGTTTCCCTCCGCGACGGTGCTTTATCTCTGTGCGCTACTGGCGCtt > 1:989199/1‑301 (MQ=255) ttATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCtt < 2:1122932/301‑1 (MQ=255) atgaactgggaattctcTGCTCGAAAGAACAGACAGACAACGAAATTCGTGGAATTGAGCACCTTTAACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATAGTTCCGCCTTCGTTACCTCCTGAGAATCCTTTTTAGCAACGCTGGGCTACCGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGTAGCTTTc < 1:703209/285‑1 (MQ=255) aTCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGACGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCgtt > 2:606396/1‑300 (MQ=255) cacgacgctcttccgatcTCAGAAGATCAGTCAGCCAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTg < 1:204030/284‑1 (MQ=255) aaCTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCCCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGGCGAACTGCTGGCGGAAAAGTTACGGCAGTTTCCCGTCGCGGTGGGTCTTTATCTTGGTgcggctcccgtgcttt > 1:1471833/1‑284 (MQ=255) aaCTGCGGATTGCCGGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGt < 1:1158795/301‑1 (MQ=255) gATTGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGCTCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAATGGTTAGGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGGGGACTTGTCTGTGTGCGTTTACGGAGGTGTCTGTCAgtgtt > 1:944889/1‑297 (MQ=255) tGCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCGTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTg < 2:743900/301‑1 (MQ=255) gCCTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTg > 2:854282/1‑300 (MQ=255) ccTGCTCAGAAGATCAGTCGGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCg < 1:735482/301‑1 (MQ=255) ccTGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGAGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGTTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGc > 1:733720/1‑300 (MQ=255) tGCTCAGACGATCAGTCAGACAACGAAATGCGTTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGCCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTg < 1:375476/301‑1 (MQ=255) tGCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTg > 2:375911/1‑301 (MQ=255) gCTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGa > 2:1186590/1‑301 (MQ=255) cTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGCAATGCTGGCGGACGAGTTACTTAAGCTTCCCGCCGAGACGTTGCTCTATCATTGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCTGCttagtcgctcat > 1:206823/1‑291 (MQ=255) cTCAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGaa > 2:1084011/1‑301 (MQ=255) cAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGTGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATCCCGAAATGCTGCCGGCAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGACAAGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTTTGTCAGCTTCCTGcttatac > 1:652401/1‑294 (MQ=255) cAGAAGATCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTgagatcggaagagcacacgg > 2:204236/1‑282 (MQ=255) gaagaTCAGTCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGACCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAg > 1:53234/1‑301 (MQ=255) | TGAAATCGCTCGGCTGGCGGGAGTGTCGCGGACCACTGCAAGCTATGTTATTAACGGCAAAGCGAAGCAATACCGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAG > NC_000913/88039‑88625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |