| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,270,488 | (C)7→8 | intergenic (+886/+137) | yhaC → / ← garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,270,481 | 1 | . | C | 91.7% | 351.8 / 20.4 | 108 | intergenic (+879/+144) | yhaC/garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/3); new base C (49/50); total (55/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCG‑ATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑T‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGACCGCATCAATGCCATGCTGATGTACA > NC_000913/3270182‑3270775 | cAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCG‑ATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCCGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGTTGCGCTCTTCCACCACCCTTTCACCCTTCCCTGACCCCGCGTGCGCGGGCCCTCGACTGTTTGCTCCCTGTTGCACTGGTCGGTGGtt‑t > 1:372152/1‑300 (MQ=255) 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(MQ=255) cggcggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTg < 2:319221/301‑1 (MQ=255) cggcggTTGCCTCACTGTTGCACTAGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAACCGGCGCCTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTCCGCATTCCAATCCCCAGTGCCCCGGCGCTCTTCCGTGACGCCCGGCAG‑TATTGATCATAAGCCCACCGGAATCCTTCGTCCACCTCACCCATGCTGGTCAATACCCt > 1:751206/1‑300 (MQ=255) cggTTTGCTCTCTGTGGCACTGGCCGCGTGTT‑T‑C‑C‑C‑CCTCCAGGCGTTACCTGGCACCCGGCCCTATGGAGCACGTACTCTCCTCCCCTCCGCCCGTCGCCCCCGAAGTGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGGATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCATTCGCCGGGGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAg < 1:385249/301‑1 (MQ=255) cggTTTGCGCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCTCCCGAAGAGGACGACGACGACGCGGCGACTGTCTGGTTAGCTTCGGCGC‑GAAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTTAACACGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGTTATTACGTGAAGCACGGCAGTTCTTG‑TCATAAGCCCCCCGGAATGCTTAGTCTACCTGACCTAGCCTGGCCaaaccgcgtaca > 1:503165/1‑291 (MQ=255) ggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGGGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGa > 2:893225/1‑301 (MQ=255) gTTTACTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCCCGGCAGATCTTG‑TCATAATCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTACGCGGGTCACTAcagatcggaa > 1:1149967/1‑292 (MQ=255) ctctGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTGTCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGGGAAGCAAGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGTAAGCCTTCTTCCAACGTACCCTGCCTGTTCATCACTCTGAAACCCGCATCa > 1:755558/1‑301 (MQ=255) ngTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCCGATATTG‑TCCTAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCCACGTACCTATGCTGGTCCAATCGCTGAAGACCGCATCAATg > 2:338858/2‑301 (MQ=255) gTTGCACTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAATCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATTCGCTTAAGACCGCCTCCATg > 1:304983/1‑300 (MQ=255) ccTGGTCGTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGACCGCATCAATGCCATGc < 2:428405/300‑1 (MQ=255) gTGGGTT‑TCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCCCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCACTCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAACACCGCCTCAATGCCATGCTGATGTa > 1:36186/1‑301 (MQ=255) | CAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCG‑ATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTT‑T‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGC‑GCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTG‑TCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGACCGCATCAATGCCATGCTGATGTACA > NC_000913/3270182‑3270775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |