| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,168,604 | A→G | intergenic (‑60/+145) | mqsR ← / ← ygiV | GCU‑specific mRNA interferase toxin of the MqsR‑MqsA toxin‑antitoxin system; biofilm/motility regulator; anti‑repressor/transcriptional repressor for mcbR biofilm gene |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,168,604 | 0 | A | G | 99.0% | 367.4 / NA | 104 | intergenic (‑60/+145) | mqsR/ygiV | GCU‑specific mRNA interferase toxin of the MqsR‑MqsA toxin‑antitoxin system; biofilm/motility regulator; anti‑repressor/transcriptional repressor for mcbR biofilm gene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (55/47); total (55/49) | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACCTGGCCTGTAACAAGCCTGGGTCTGTAAACATCCTGCCAGATAGTATGATCAGAGTAGGTGGTCATGCTTTTATAAAAGTCGCTCTCTGATAATCCAATGATAACATTACACATACCATCAAAATCCAAACCTAACTCATCTGCATTTAACAGGGCACTACGTGTTGTACGAACTTGCCCGGCATTGACAAGTTTTTTAACCTGACTCAAACGTGTATGTGGTGTGCGTTTTTCCATAACCCCCGCCTCCCTGTTACTTTAGTTATAACCTAAAAGGTTAATTACAGCAATGAAAAAGCACCTAAAAGGTTAGTTAGATGTACGGAGATAGTGACCACACAAAACGTATTCTTTAAGGAAAGTGATTGACCATATAAGAAAGTGGCGCATTAGTAGCGCCAGTTTGAAGCAGGAATTTATAAGGGAAGCTGGAGTCAGGCATCACGCCAACGGCACATAAACATCCGTTTCCAGTCGCTGCTCTGTCACCCCTTCGGCAAGATTGGTGTAGTGAAACAGAATCGGT‑GCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGT > NC_000913/3168306‑3168896 | aCCTGGCCTGTAACAAGCCTGGGTCTGTAAACATCCTGCCAGATAGTATGATCAGAGTAGGTGGTCATGCTTTTATAAAAGTCGCTCTCTGATAATCCAATGATAACATTACACATACCATCAAAATCCAAACCTAACTCATCTGCATTTAACAGGGCACTACGTGTTGTACGAACTTGCCCGGCATTGACAAGTTTTTTAACCTGACTCAAACGTGTATGTGGTGTGCGTTTTTCCATAACCCCCGCCTCCCTGTTACTTTAGTTATAACCTAAAAGGTTAATTACAGCAATGAAAAGGc < 1:851872/301‑1 (MQ=255) 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ttaccacAATGGAAAAGGCCCTAAAAGGTTAGTTAGATGTACGGGGATAGTGACCCAACAAAACGTTATATTTAAGGAAAGTGATTTGACATATAAGAAAGTGGCGCATTAGTAGCGCCAGTTTGAAGCAGGAATTTATAAGGGAAGCTGGAGTCAGGCATCACGCCAACGGCACATAAACATCCGTTTCCAGTCGCTGCTCTGTCACCCCTTCGGCAAGATTGGTGTAGTGAAACAGAATCGGT‑GCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATAc < 1:1014901/295‑1 (MQ=255) cAGCAATGAAAAGGCACCTAAAAGGTTAGTTAGATGTACGGAGATAGTGACCACACAAAACGTATTCTTTAAGGAAAGTGATTGACCATATAAGAAAGTGGCGCATTAGTAGCTCCAGTTTGAAGCAGGAATTTATAAGGGAAGCTGGAGTCAGGCATCACGCCAACGGCACATAAACATCCGTTTCCAGTCGCTGCTCTGTCACCCCTTCGGCAAGAATGGTGTAGTAAAACAGAATCGGT‑GCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGCATGATCCCCCATACCgt > 2:34741/1‑301 (MQ=255) aGCAATGAAAAGGCACCTAAAAGGTTAGTTAGATGTACGGAGATAGTGACCACACAAAACGTATTCTTTAAGGAAAGTGATTGACCATATAAGAAAGTGGCGCATTAGTAGCGCCAGTTTGAAGCAGGAATTTATAAGGGAAGCTGGAGTCAGGCATCACGCCAACGGCACATAAACATCCGTTTCCAGTCGCTGCTCTGTCACCCCTTCGGCAAGATTGGTGTAGTGAAACAGAATCGGT‑GCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCgtg > 2:1154808/1‑301 (MQ=255) 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ACCTGGCCTGTAACAAGCCTGGGTCTGTAAACATCCTGCCAGATAGTATGATCAGAGTAGGTGGTCATGCTTTTATAAAAGTCGCTCTCTGATAATCCAATGATAACATTACACATACCATCAAAATCCAAACCTAACTCATCTGCATTTAACAGGGCACTACGTGTTGTACGAACTTGCCCGGCATTGACAAGTTTTTTAACCTGACTCAAACGTGTATGTGGTGTGCGTTTTTCCATAACCCCCGCCTCCCTGTTACTTTAGTTATAACCTAAAAGGTTAATTACAGCAATGAAAAAGCACCTAAAAGGTTAGTTAGATGTACGGAGATAGTGACCACACAAAACGTATTCTTTAAGGAAAGTGATTGACCATATAAGAAAGTGGCGCATTAGTAGCGCCAGTTTGAAGCAGGAATTTATAAGGGAAGCTGGAGTCAGGCATCACGCCAACGGCACATAAACATCCGTTTCCAGTCGCTGCTCTGTCACCCCTTCGGCAAGATTGGTGTAGTGAAACAGAATCGGT‑GCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGT > NC_000913/3168306‑3168896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |