| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,758,369 | G→A | A498V (GCA→GTA) | selB ← | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,758,369 | 0 | G | A | 98.3% | 385.4 / NA | 119 | A498V (GCA→GTA) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (49/66); minor base T (1/1); total (52/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTGCTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTGAATATAACCAGGCTGT > NC_000913/3758074‑3758665 | cgTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGCTCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCCCCAACCAGTGGCCCTACtttt > 1:221638/1‑301 (MQ=255) gTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACttttt > 2:409883/1‑301 (MQ=255) aaaGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCGAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGc < 2:883994/301‑1 (MQ=255) aaGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGcc < 2:1028860/301‑1 (MQ=255) 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aTCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTCGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATTGACTGCTGCTCTTCGCTGAAg > 2:340236/1‑300 (MQ=255) tGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTTCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCCCTTTTGCCAGGTCACGCTCCCCCCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGCCacgctcggaagagcgtcgggtcggtaacaa > 1:753227/1‑272 (MQ=255) gCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGaggtcggaagag > 1:1024802/1‑289 (MQ=255) 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cGTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTg < 1:1031535/301‑1 (MQ=255) gTCACCAAACAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTACTGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCtatacaccacctaa > 1:674376/1‑291 (MQ=255) aaaCAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGCTGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTAAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCTTCTTCCCTTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTAATGATACGTCCCTAATGTTTCGAGACTCTTACGCTTCCCGCGGGCGTCAACCGGCGCCTTCCACAACCGATAAACTGCGTGACtata > 1:85977/1‑300 (MQ=255) aaCAGTGGCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTGAATATAAc < 1:346947/301‑1 (MQ=255) gCTCTACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTGAATATAACCAgg > 1:387363/1‑298 (MQ=255) ctctACTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTGAATATAACCAGGCTGt < 2:103338/301‑1 (MQ=255) | CGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGAAATCCGCCGCGCAGGTTGAACCACACTCCTGATCGAGATCGCGGATCATATTGGCAAACTCGACAATCCGATCGTTACGGTAATAACGATCTTTAACGATCGCGGTAATTATTCCTTGCTGCGCCGCCTGGCGTAGAGTCAGGCGCATTGCCTGCTCGTCGGTTCCCGTCTCTTTTGCCAGGTCACGCACCCACCACGGTTCGTCACCAAACAGTGGCTCTGCTTTTTGCCAGATGGCCTGCTGCTCTTCGCTGAAGCCCGCTTTGTGATCTGGCAGATGCAGCCAGCCGTGATGGCTGTGGATGTCGCCGCTTTCGCGCATCTTTTCAATCAGCAACAGTACCAGCGCTTCATCTTCCATTGGCAACGCCATACGTCGCAGACGTTCGCGCCCAGGGCCAGGTTCATCGCGATGTTGCTCATGATAAGTCGCTAATGTGTCGAGAATTTTCCGCTGCCAGCGGGCGGCAACCGGCGCATTCAACAAGCTATAACCAGCCTGAATATAACCAGGCTGT > NC_000913/3758074‑3758665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |