| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 323,369 | G→A | V344V (GTG→GTA) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 323,369 | 0 | G | A | 98.6% | 485.6 / NA | 141 | V344V (GTG→GTA) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (71/68); minor base T (1/1); total (72/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAACACCACTCAAATTTGGCGCGA > NC_000913/323071‑323664 | cccccACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCCTGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAAt > 1:1150989/1‑301 (MQ=255)cccccACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGAACACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTTCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCCCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTTCGGTAAt > 2:253238/1‑301 (MQ=255) cGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTcc < 2:377200/301‑1 (MQ=255) tAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGACTTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATTGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGAGGTAATTTCTCCGCTACTTggcgg > 2:27952/1‑301 (MQ=255) aTGTATTGATTACCATGCTGGCGAGCAGGGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTggcggc < 1:953929/299‑1 (MQ=255) aTGTATTGATCACCATGCTGGAGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGGTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGCCCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAATAGTTTCATCTGTTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTggcggc < 1:20107/299‑1 (MQ=255) aTTGAATACCATGAGGGCGGGCGGTGCCGTGGGTGCTCGGTTGACGGGATACAACCCCTG‑GCTGACAGGACCGGGCGACGCTGGGCATGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGTTAACGGGCGTTATGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCCGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTTTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCGACTTGGCGGCTAtaaa < 1:814144/301‑1 (MQ=255) tcttccgatcgcgtgtgTGCAGGTTGGACGGCAGACAACACCTG‑GCTGAACGGACAGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTAc < 1:152997/285‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGCGGTTGGGGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTAc < 1:418643/300‑1 (MQ=255) ccGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGc > 2:527371/1‑298 (MQ=255) 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ggTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCCTTTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACACTACGCCTGCTCtt > 2:48174/1‑301 (MQ=255) gTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑CATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCttt > 1:83095/1‑301 (MQ=255) tGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGGCCGCGCGAAGCTGGGCACTTTGATGGTCCTGAAGAGGTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGATGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTAATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTa < 1:287319/301‑1 (MQ=255) 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CCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTG‑GCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATG‑AATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAACACCACTCAAATTTGGCGCGA > NC_000913/323071‑323664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |